197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2590 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  100 
 
 		 384 aa  775    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  67.45 
 
 		 426 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  67.19 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  68.41 
 
 		 391 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  67.36 
 
 		 408 aa  532  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  66.23 
 
 		 384 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  65.97 
 
 		 384 aa  531  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  66.67 
 
 		 386 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  66.41 
 
 		 393 aa  525  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  66.84 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  66.84 
 
 		 387 aa  524  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  63.02 
 
 		 386 aa  519  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  66.84 
 
 		 389 aa  503  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  64.58 
 
 		 387 aa  501  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  65.18 
 
 		 390 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  64.66 
 
 		 392 aa  491  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  63.71 
 
 		 391 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  63.21 
 
 		 385 aa  491  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  62.02 
 
 		 387 aa  488  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  63.71 
 
 		 391 aa  484  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  59.43 
 
 		 386 aa  471  1.0000000000000001e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  60.94 
 
 		 391 aa  468  9.999999999999999e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  40.42 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  40.85 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  40.32 
 
 		 384 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  38.7 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  38.7 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  38.7 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  38.7 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  38.7 
 
 		 408 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  39.18 
 
 		 385 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  39.84 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  35.7 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  38.86 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  32.82 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  32.47 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  33.5 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  32.92 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  34.72 
 
 		 450 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  33.42 
 
 		 513 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  32.91 
 
 		 513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  32.91 
 
 		 513 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  34.79 
 
 		 533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 435 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  32.74 
 
 		 523 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  32.15 
 
 		 510 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  32.31 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  32.31 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  33.67 
 
 		 517 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  32.05 
 
 		 507 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  35.52 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  32.66 
 
 		 513 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  33.67 
 
 		 516 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  33.99 
 
 		 439 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2373  UxaA family hydrolase  32.84 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574127  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0825  putative D-galactarate dehydratase/altronate dehydratase  32.84 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1156  UxaA family hydrolase  32.84 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1079  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  32.84 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1789  UxaA family hydrolase  32.84 
 
 		 440 aa  176  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  33 
 
 		 523 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1606  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  32.75 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  32.16 
 
 		 538 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  31.58 
 
 		 509 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  30.95 
 
 		 533 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  30.79 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  32.82 
 
 		 514 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  31.47 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  30.9 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  30.95 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  30.05 
 
 		 508 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  32.32 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  31.22 
 
 		 525 aa  169  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  30.53 
 
 		 514 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  30.31 
 
 		 508 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  33.42 
 
 		 507 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  33.5 
 
 		 508 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  30.79 
 
 		 514 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  32.01 
 
 		 393 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  32.48 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  31.71 
 
 		 508 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  31.2 
 
 		 507 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  30.49 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  30.3 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  30.33 
 
 		 501 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  30.35 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  30.43 
 
 		 523 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  32.26 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  30.65 
 
 		 526 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  32.09 
 
 		 512 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  29.7 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  29.65 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  30.89 
 
 		 507 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  30.63 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  33.67 
 
 		 507 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  29.74 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  29.62 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  29.32 
 
 		 508 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  29.49 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  30.27 
 
 		 500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  29.52 
 
 		 507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>