197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0481 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  100 
 
 
385 aa  784    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  64.69 
 
 
387 aa  513  1e-144  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  62.69 
 
 
386 aa  501  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  64.92 
 
 
391 aa  500  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  63.21 
 
 
384 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  58.75 
 
 
390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  58.49 
 
 
408 aa  465  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  61.1 
 
 
389 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  58.47 
 
 
384 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  58.75 
 
 
391 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  57.4 
 
 
392 aa  463  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  58.47 
 
 
384 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  58.03 
 
 
391 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  56.85 
 
 
387 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  56.85 
 
 
387 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  56.54 
 
 
386 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  57.77 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  58.95 
 
 
387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  55.09 
 
 
386 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  57.51 
 
 
393 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  54.55 
 
 
426 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  55.18 
 
 
426 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  41.58 
 
 
384 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  40.85 
 
 
384 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  40.32 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  40.67 
 
 
390 aa  292  6e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  41.78 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  39.58 
 
 
408 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  39.58 
 
 
388 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  39.58 
 
 
388 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  39.58 
 
 
388 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  39.58 
 
 
408 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  37.63 
 
 
385 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  40.1 
 
 
395 aa  242  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  33.08 
 
 
505 aa  224  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  36.22 
 
 
526 aa  218  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  32.62 
 
 
388 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  33.76 
 
 
533 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  31.22 
 
 
525 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  31.87 
 
 
533 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  31.95 
 
 
513 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  31.75 
 
 
517 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  31.87 
 
 
508 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  31.62 
 
 
507 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  32.49 
 
 
507 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  30.63 
 
 
507 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  30.63 
 
 
507 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  31.11 
 
 
507 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  30.38 
 
 
507 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  32.91 
 
 
512 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  31.75 
 
 
516 aa  186  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  31.2 
 
 
403 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  30.1 
 
 
507 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  29.79 
 
 
523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  29.85 
 
 
507 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  30.1 
 
 
508 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  31.44 
 
 
503 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  31.52 
 
 
508 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  30.27 
 
 
402 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  30.17 
 
 
515 aa  179  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  31.11 
 
 
512 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  30.71 
 
 
538 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  29.82 
 
 
501 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  30.48 
 
 
523 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  30.23 
 
 
523 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  30.03 
 
 
510 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  29.47 
 
 
508 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  29.49 
 
 
508 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  31.23 
 
 
500 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  29.11 
 
 
519 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  29.47 
 
 
510 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  30.5 
 
 
508 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  31.3 
 
 
511 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  30.13 
 
 
507 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  33.51 
 
 
493 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  30.9 
 
 
500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  30.6 
 
 
513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  31.06 
 
 
514 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  30.1 
 
 
513 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  29.62 
 
 
509 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  30.73 
 
 
500 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  29.85 
 
 
513 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  30.08 
 
 
500 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  30.81 
 
 
514 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  28.61 
 
 
507 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  28.43 
 
 
508 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  30.46 
 
 
515 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  32.02 
 
 
518 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  32.52 
 
 
393 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  28.4 
 
 
513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  30.05 
 
 
514 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  28.57 
 
 
508 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  31.55 
 
 
507 aa  166  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  29.82 
 
 
500 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  30.51 
 
 
498 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  29.29 
 
 
507 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  28.79 
 
 
510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190933 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02993  (D)-galactarate dehydrogenase  30.26 
 
 
523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4442  galactarate dehydratase  30.26 
 
 
523 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.648393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02944  hypothetical protein  30.26 
 
 
523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>