197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3706 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  100 
 
 		 426 aa  877    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  90.38 
 
 		 426 aa  801    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  74.74 
 
 		 393 aa  622  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  70.65 
 
 		 387 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  70.65 
 
 		 387 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  69.25 
 
 		 386 aa  555  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  70.1 
 
 		 391 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  68.04 
 
 		 408 aa  538  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  67.19 
 
 		 384 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  66.15 
 
 		 386 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  67.1 
 
 		 387 aa  523  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  68.56 
 
 		 391 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  68.3 
 
 		 391 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  66.92 
 
 		 389 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  59.9 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  59.11 
 
 		 384 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  55.18 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  57.77 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  55.56 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  54.89 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  54.78 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  53.51 
 
 		 387 aa  394  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  40.36 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  38.6 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  38.6 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  39.36 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  38.6 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  38.6 
 
 		 408 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  39.32 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  38.6 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  38.54 
 
 		 384 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  40.36 
 
 		 390 aa  246  8e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  35.94 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  37.14 
 
 		 395 aa  201  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  31.11 
 
 		 505 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  33.25 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  32.51 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  32.07 
 
 		 507 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  32.24 
 
 		 533 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  31.93 
 
 		 507 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  31.93 
 
 		 507 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  32.2 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  32.37 
 
 		 513 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  32.38 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  32.59 
 
 		 513 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 514 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  32.13 
 
 		 513 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  33.85 
 
 		 533 aa  166  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  32.26 
 
 		 507 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  32.41 
 
 		 513 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  31.22 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  32.59 
 
 		 517 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  31.77 
 
 		 508 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  32.01 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  31.25 
 
 		 508 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  30.86 
 
 		 501 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  30.67 
 
 		 508 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  33.17 
 
 		 538 aa  159  9e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  31.44 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  32.1 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  32.27 
 
 		 523 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  33.08 
 
 		 510 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  31.62 
 
 		 523 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  31.54 
 
 		 500 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  30.53 
 
 		 498 aa  156  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  32.43 
 
 		 526 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  29.76 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  30.84 
 
 		 450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  29.51 
 
 		 508 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  30.45 
 
 		 508 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  31.33 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  31.77 
 
 		 514 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  31.07 
 
 		 500 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  32.27 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  29.75 
 
 		 525 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  30.52 
 
 		 500 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1606  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  30 
 
 		 429 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  30.7 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  29.38 
 
 		 508 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  30.52 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  31.74 
 
 		 508 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  30.54 
 
 		 509 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  30.52 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  30.52 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  30.05 
 
 		 507 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  32.02 
 
 		 514 aa  150  4e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  31.62 
 
 		 512 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  30.37 
 
 		 523 aa  150  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  31.92 
 
 		 508 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  30.31 
 
 		 509 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  29.35 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  31.75 
 
 		 507 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  30.75 
 
 		 507 aa  147  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  29.71 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  29.22 
 
 		 515 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2373  UxaA family hydrolase  30.9 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  30.17 
 
 		 439 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  30.71 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0825  putative D-galactarate dehydratase/altronate dehydratase  30.9 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>