197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2960 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2373  UxaA family hydrolase  81.03 
 
 		 440 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574127  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1606  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  81.1 
 
 		 429 aa  693    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  100 
 
 		 450 aa  920    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0825  putative D-galactarate dehydratase/altronate dehydratase  81.03 
 
 		 440 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1156  UxaA family hydrolase  81.03 
 
 		 440 aa  701    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1079  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  81.03 
 
 		 440 aa  701    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1789  UxaA family hydrolase  81.03 
 
 		 440 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  86.79 
 
 		 435 aa  784    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  96.36 
 
 		 439 aa  863    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  70.1 
 
 		 403 aa  576  1.0000000000000001e-163  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  67.96 
 
 		 402 aa  553  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  35.15 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  34.92 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  36.14 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  36.14 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  36.14 
 
 		 388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  36.54 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  37.92 
 
 		 525 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  38.1 
 
 		 385 aa  229  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  38.25 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  35.57 
 
 		 508 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  35.51 
 
 		 519 aa  220  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  36.48 
 
 		 507 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  37.47 
 
 		 533 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  35.05 
 
 		 509 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  35.12 
 
 		 523 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  35.42 
 
 		 508 aa  216  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  35.8 
 
 		 513 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  33.08 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  35.82 
 
 		 508 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  36.98 
 
 		 516 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  36.92 
 
 		 517 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  36.27 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  35.97 
 
 		 513 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  35.45 
 
 		 526 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  35.66 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  34.46 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  37.56 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  35.97 
 
 		 513 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  36.28 
 
 		 508 aa  210  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  34.31 
 
 		 523 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  35.89 
 
 		 509 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  34.99 
 
 		 523 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  34.27 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  35.51 
 
 		 510 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  34.29 
 
 		 510 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  34.37 
 
 		 508 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  32.42 
 
 		 505 aa  207  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  33.79 
 
 		 514 aa  206  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  34.55 
 
 		 515 aa  206  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  34.57 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  36.05 
 
 		 507 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  34.15 
 
 		 515 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  33.56 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  34.69 
 
 		 501 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  34.94 
 
 		 508 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  34.07 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  34.42 
 
 		 533 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 510 aa  200  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  34.24 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  34.45 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  34.13 
 
 		 513 aa  199  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  34.15 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  35.66 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  33.49 
 
 		 514 aa  197  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  34.76 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  33.73 
 
 		 509 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  33.98 
 
 		 507 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  34.22 
 
 		 507 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  34.22 
 
 		 507 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  34.13 
 
 		 510 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  35.51 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  34.43 
 
 		 500 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  34.53 
 
 		 500 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  33.09 
 
 		 508 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  34.29 
 
 		 500 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  32.17 
 
 		 388 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  33.41 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  33 
 
 		 493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  34.72 
 
 		 384 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  33.41 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  34.29 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  32.34 
 
 		 387 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  33.5 
 
 		 384 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  32.34 
 
 		 387 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  31.59 
 
 		 393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  31.96 
 
 		 408 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  33.83 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  32.05 
 
 		 391 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  31.13 
 
 		 387 aa  171  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  31.83 
 
 		 384 aa  170  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  33.58 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  31.14 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  30.84 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  32.77 
 
 		 532 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1998  galactarate dehydratase  32.56 
 
 		 520 aa  166  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257982  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  32.85 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  31.22 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  31.17 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  31.87 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>