197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2216 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2216  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  100 
 
 
387 aa  786    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.166546  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1140  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  81.51 
 
 
391 aa  652    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.944509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1124  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  77.28 
 
 
386 aa  632  1e-180  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0481  Galactarate dehydratase  64.69 
 
 
385 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2462  Altronate dehydratase  62.83 
 
 
392 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1012  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  62.57 
 
 
390 aa  489  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2590  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  62.02 
 
 
384 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0469328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2051  Altronate dehydratase  57.47 
 
 
384 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000291794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4418  Altronate dehydratase  56.19 
 
 
384 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0892  Altronate dehydratase  56.74 
 
 
408 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2005  Altronate dehydratase  56.4 
 
 
387 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3819  Altronate dehydratase  56.99 
 
 
391 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.257566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2003  Altronate dehydratase  56.4 
 
 
387 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1766  Altronate dehydratase  57.96 
 
 
389 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0211518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2156  Altronate dehydratase  55.09 
 
 
386 aa  428  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2375  Altronate dehydratase  55.61 
 
 
386 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.602236  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6087  Altronate dehydratase  54.92 
 
 
391 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2324  Altronate dehydratase  55.32 
 
 
387 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5979  Altronate dehydratase  54.4 
 
 
426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.25481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3529  Altronate dehydratase  54.15 
 
 
391 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2038  putative altronate hydrolase  52.59 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624711  normal  0.146869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3706  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  53.51 
 
 
426 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  43.31 
 
 
390 aa  294  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3804  Altronate dehydratase  39.52 
 
 
384 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6357  Altronate dehydratase  40 
 
 
384 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.194037  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5298  Altronate dehydratase  38.95 
 
 
384 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  40.16 
 
 
389 aa  262  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  36.43 
 
 
408 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  36.43 
 
 
408 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0693  hydrolase, UxaA family  36.43 
 
 
388 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0782051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0810  UxaA family hydrolase  36.43 
 
 
388 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.107485  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0767  UxaA family hydrolase  36.43 
 
 
388 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3275  Altronate dehydratase  37.7 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.549273  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4456  Altronate dehydratase  38.95 
 
 
395 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000308674  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  33.84 
 
 
505 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  34.73 
 
 
388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  31.41 
 
 
513 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  31.9 
 
 
508 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  30.87 
 
 
507 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  30.87 
 
 
507 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  31.85 
 
 
533 aa  179  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  30.61 
 
 
507 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  29.65 
 
 
523 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1545  Altronate dehydratase  32.41 
 
 
403 aa  176  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  30.67 
 
 
509 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  31.49 
 
 
507 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6916  Altronate dehydratase  31.62 
 
 
439 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  0.499575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  32.18 
 
 
526 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2960  Altronate dehydratase  31.13 
 
 
450 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  31.16 
 
 
511 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  31.77 
 
 
493 aa  169  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  30.98 
 
 
507 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  29.57 
 
 
507 aa  169  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  30.26 
 
 
512 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4298  Altronate dehydratase  31.13 
 
 
435 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  29.8 
 
 
515 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  29.95 
 
 
525 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  29.15 
 
 
508 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3855  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain-containing protein  31.98 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00201653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  30.85 
 
 
538 aa  164  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  29.31 
 
 
517 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  29.1 
 
 
514 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4019  Altronate dehydratase  33.23 
 
 
552 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  27.7 
 
 
509 aa  162  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  28.84 
 
 
533 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  28.57 
 
 
507 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  29.1 
 
 
514 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  29.35 
 
 
514 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  27.76 
 
 
519 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  28.35 
 
 
508 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  29.85 
 
 
507 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  28.57 
 
 
509 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  30.68 
 
 
548 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  29.31 
 
 
516 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  27.59 
 
 
507 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  28.5 
 
 
510 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  27.61 
 
 
523 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  29.52 
 
 
510 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2373  UxaA family hydrolase  30.34 
 
 
440 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.574127  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0825  putative D-galactarate dehydratase/altronate dehydratase  30.34 
 
 
440 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1156  UxaA family hydrolase  30.34 
 
 
440 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1079  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase  30.34 
 
 
440 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.750855  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1789  UxaA family hydrolase  30.34 
 
 
440 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  28.82 
 
 
513 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  29.03 
 
 
500 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  29.4 
 
 
507 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  28.61 
 
 
515 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  28.82 
 
 
513 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  28.96 
 
 
500 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  28.82 
 
 
513 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  29.78 
 
 
507 aa  155  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1606  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  30.12 
 
 
429 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  28.08 
 
 
509 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2430  Altronate dehydratase  30.5 
 
 
402 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  27.36 
 
 
508 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  29.14 
 
 
509 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  28.68 
 
 
510 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  28.86 
 
 
500 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  33.24 
 
 
550 aa  153  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  29.78 
 
 
510 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>