209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6828 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5737  Altronate dehydratase  57.92 
 
 		 551 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5503  Altronate dehydratase  60.95 
 
 		 554 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  62.09 
 
 		 550 aa  707    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0416  Altronate dehydratase  60.72 
 
 		 582 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4019  Altronate dehydratase  62.48 
 
 		 552 aa  696    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4785  Altronate dehydratase  61.2 
 
 		 551 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  100 
 
 		 548 aa  1128    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  60 
 
 		 540 aa  634  1e-180  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1735  Altronate dehydratase  55.78 
 
 		 546 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.969827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  34.48 
 
 		 493 aa  300  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  35.53 
 
 		 507 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  35.33 
 
 		 510 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  35.27 
 
 		 519 aa  296  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  34.18 
 
 		 507 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  33.82 
 
 		 512 aa  294  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  35.63 
 
 		 526 aa  293  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  35.22 
 
 		 496 aa  293  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  34.96 
 
 		 496 aa  292  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  34.85 
 
 		 510 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  34.12 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  35.45 
 
 		 515 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  34.48 
 
 		 500 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  34.9 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  34.48 
 
 		 500 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  33.87 
 
 		 513 aa  287  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  34.72 
 
 		 496 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  34.12 
 
 		 508 aa  286  9e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  34.13 
 
 		 507 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  34.67 
 
 		 498 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  33.63 
 
 		 533 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  34.3 
 
 		 500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  35.04 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  33.09 
 
 		 496 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  33.76 
 
 		 495 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  33.52 
 
 		 507 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  33.52 
 
 		 507 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  34.48 
 
 		 496 aa  283  8.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  33.58 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  33.94 
 
 		 503 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  33.51 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  33.76 
 
 		 513 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  33.21 
 
 		 495 aa  280  5e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  33.76 
 
 		 496 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  33.39 
 
 		 495 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  33.21 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  33.21 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  33.21 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  33.21 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  34.12 
 
 		 508 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  33.21 
 
 		 495 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  33.58 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  33.58 
 
 		 496 aa  276  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  34.24 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  33.52 
 
 		 507 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  33.46 
 
 		 525 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  34.54 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  31.8 
 
 		 523 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  32.84 
 
 		 513 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  32.3 
 
 		 513 aa  273  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  33.39 
 
 		 495 aa  272  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  33.21 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  33.57 
 
 		 508 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  34.19 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  32.73 
 
 		 509 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  31.54 
 
 		 533 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 507 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  33.64 
 
 		 511 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  33.03 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  32.97 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  32.18 
 
 		 512 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  33.21 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  34.23 
 
 		 507 aa  267  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  32.91 
 
 		 515 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  32.35 
 
 		 523 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  33.27 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  34.11 
 
 		 500 aa  263  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  32.12 
 
 		 507 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  33.39 
 
 		 507 aa  262  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  32.72 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  32.72 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  32.3 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  32.79 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  33.15 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  33.33 
 
 		 507 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  32.3 
 
 		 538 aa  258  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  32.26 
 
 		 507 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  31.99 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  31.64 
 
 		 509 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  32.97 
 
 		 508 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  32.79 
 
 		 516 aa  248  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  32.42 
 
 		 508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  32.43 
 
 		 500 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  32.61 
 
 		 500 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  33.64 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  31.55 
 
 		 518 aa  229  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  33.02 
 
 		 513 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  31.47 
 
 		 524 aa  228  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05250  D-galactarate dehydratase  31.35 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0707  UxaA family hydrolase  32.65 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.250621  normal  0.872847 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0753  UxaA family hydrolase  32.65 
 
 		 408 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.371457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>