207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5503 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0416  Altronate dehydratase  57.27 
 
 		 582 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5503  Altronate dehydratase  100 
 
 		 554 aa  1142    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031137 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6828  Altronate dehydratase  60.95 
 
 		 548 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1161  Altronate dehydratase  68.6 
 
 		 550 aa  796    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4785  Altronate dehydratase  66.12 
 
 		 551 aa  758    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4019  Altronate dehydratase  57.97 
 
 		 552 aa  639    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5737  Altronate dehydratase  54.51 
 
 		 551 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10366 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4258  Altronate dehydratase  54.91 
 
 		 540 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.350711  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1735  Altronate dehydratase  54.18 
 
 		 546 aa  592  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.969827  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1064  altronate hydrolase  33.94 
 
 		 505 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.343724  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6308  Altronate dehydratase  34.71 
 
 		 507 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.859244 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6103  D-galactarate dehydratase  34.12 
 
 		 510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  34.55 
 
 		 507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  34.73 
 
 		 507 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  34.71 
 
 		 507 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  34.71 
 
 		 507 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  34.89 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  33.82 
 
 		 507 aa  280  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  34.18 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1749  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.548358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  32.79 
 
 		 493 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  34.17 
 
 		 508 aa  278  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3967  Altronate dehydratase  34.41 
 
 		 508 aa  277  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.816529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  33.87 
 
 		 513 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4262  galactarate dehydratase  33.64 
 
 		 507 aa  276  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.892671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  32.92 
 
 		 509 aa  274  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1702  Altronate dehydratase  32.85 
 
 		 508 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  33.03 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  32.97 
 
 		 500 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  33.27 
 
 		 507 aa  270  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  32.26 
 
 		 508 aa  269  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0264  Altronate dehydratase  32.97 
 
 		 500 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.530336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0287  Altronate dehydratase  33.33 
 
 		 500 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2347  galactarate dehydratase  32.14 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  31.69 
 
 		 523 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  32.09 
 
 		 533 aa  266  8e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  33.82 
 
 		 513 aa  266  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  31.87 
 
 		 514 aa  266  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3904  galactarate dehydratase  31.94 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  31.87 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  32.49 
 
 		 523 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3898  uronate isomerase  32.61 
 
 		 510 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.90307  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1615  putative altronate hydrolase (ALTRONIC acid hydratase) protein  31.88 
 
 		 519 aa  263  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135092  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  31.82 
 
 		 496 aa  264  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2082  galactarate dehydratase  31.96 
 
 		 509 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.315134  normal  0.334548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4278  Altronate dehydratase  31.03 
 
 		 507 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  31.69 
 
 		 496 aa  263  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0724  Altronate dehydratase  32.91 
 
 		 515 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1952  Galactarate dehydratase  31.76 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  33.22 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  32.97 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3799  Altronate dehydratase  33.39 
 
 		 526 aa  261  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  32.55 
 
 		 509 aa  260  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  32.36 
 
 		 523 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  32.79 
 
 		 513 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  32.19 
 
 		 508 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  31.45 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  35.39 
 
 		 503 aa  258  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  31.51 
 
 		 496 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  30.73 
 
 		 496 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  30.73 
 
 		 496 aa  256  5e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  31.45 
 
 		 513 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  33.33 
 
 		 525 aa  256  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0955  glycogen debranching protein GlgX  32.19 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00705486  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  30.85 
 
 		 495 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  31.27 
 
 		 496 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  30.67 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3576  Altronate dehydratase  31.46 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  30.67 
 
 		 495 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  33.82 
 
 		 511 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1862  galactarate dehydratase  33.69 
 
 		 538 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  31.09 
 
 		 496 aa  253  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  30.49 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  30.49 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  30.31 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  30.49 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  30.49 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  32.48 
 
 		 501 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  30.49 
 
 		 495 aa  252  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6583  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase domain protein  32.14 
 
 		 517 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0600477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  33.45 
 
 		 498 aa  251  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  31.52 
 
 		 514 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  32.73 
 
 		 512 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  30.73 
 
 		 496 aa  244  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  33.75 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0179  galactarate dehydratase  31.35 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  31.53 
 
 		 508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0495  Altronate dehydratase  30.95 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  31.53 
 
 		 500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  33.82 
 
 		 500 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  29.22 
 
 		 495 aa  230  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  33.64 
 
 		 500 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6599  galactarate dehydratase  31.49 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.257875 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1451  altronate hydrolase  35.71 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0207  Altronate dehydratase  34.01 
 
 		 390 aa  220  7e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0126  Altronate dehydratase  37.18 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3442  galactarate dehydratase  30.61 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3513  galactarate dehydratase  30.61 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3550  galactarate dehydratase  30.61 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3444  galactarate dehydratase  30.61 
 
 		 523 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>