More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2952 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 876 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 876 aa  689    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 871 aa  648    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 875 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 874 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 886 aa  661    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 876 aa  664    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 867 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 892 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 884 aa  640    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 880 aa  669    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 875 aa  689    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28371  alanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 930 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.578023 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1201  alanyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 885 aa  640    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 874 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 874 aa  685    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 880 aa  669    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 880 aa  666    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 880 aa  667    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 874 aa  678    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 860 aa  659    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 860 aa  666    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 899 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 871 aa  648    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 871 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 863 aa  698    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 874 aa  690    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 874 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 874 aa  646    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 880 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  44.64 
 
 		 873 aa  660    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 874 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0451  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 883 aa  653    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 882 aa  666    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 897 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 886 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2104  alanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 883 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.653271  normal  0.762887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 876 aa  693    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 880 aa  675    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 864 aa  694    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 880 aa  669    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 874 aa  645    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 886 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  45.46 
 
 		 899 aa  645    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 862 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 881 aa  684    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 874 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 905 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 875 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1279  alanyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 881 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.302491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1987  alanyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 884 aa  653    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 874 aa  670    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 875 aa  680    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 890 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 874 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 886 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 874 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 874 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 891 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 868 aa  656    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  45.12 
 
 		 892 aa  672    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 890 aa  646    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 884 aa  695    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2201  alanyl-tRNA synthetase  58.42 
 
 		 885 aa  983    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 902 aa  644    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2372  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 883 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726035  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 897 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 865 aa  691    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 909 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 879 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 879 aa  664    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 874 aa  708    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 874 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 874 aa  670    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 874 aa  670    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 869 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 874 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 880 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 874 aa  686    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 874 aa  683    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 878 aa  699    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 882 aa  640    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  43.79 
 
 		 906 aa  640    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 880 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 897 aa  685    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 885 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 878 aa  670    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 874 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 878 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 880 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0598  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 885 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 900 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 860 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 876 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>