More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0050 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 876 aa  731    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 876 aa  730    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1979  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 874 aa  695    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 871 aa  1797    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 875 aa  750    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 874 aa  717    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 876 aa  652    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 867 aa  699    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 880 aa  783    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 884 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 880 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1042  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 876 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 900 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 874 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 874 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 874 aa  747    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 880 aa  674    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 880 aa  670    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 880 aa  671    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 874 aa  723    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 860 aa  708    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 860 aa  713    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 899 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1460  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 890 aa  672    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.124208  hitchhiker  0.00581407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 871 aa  691    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 874 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 886 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 874 aa  748    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 886 aa  718    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 891 aa  660    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 880 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 874 aa  726    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0926  alanine--tRNA ligase  43.84 
 
 		 873 aa  691    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.961534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 874 aa  719    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 874 aa  726    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 882 aa  764    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 897 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 874 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 879 aa  720    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 875 aa  723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 876 aa  775    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 880 aa  724    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 864 aa  735    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 880 aa  674    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 886 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 899 aa  699    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 862 aa  687    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 874 aa  726    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 881 aa  767    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 874 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 905 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3737  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 891 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0179762  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2745  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 892 aa  681    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.376883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 878 aa  810    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0590  alanyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 876 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 875 aa  735    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1571  alanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 890 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.673823  decreased coverage  0.000202808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 874 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2910  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 878 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.70978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 874 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 874 aa  691    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1734  alanyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 891 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 868 aa  674    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 897 aa  652    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 890 aa  685    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 884 aa  765    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 892 aa  744    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 886 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1719  alanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 874 aa  700    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 886 aa  690    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 897 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1359  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 882 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00180995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 865 aa  736    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1266  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 909 aa  641    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2323  alanyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 875 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0626442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 879 aa  682    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 879 aa  681    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 874 aa  688    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 874 aa  640    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 874 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 874 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 869 aa  713    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 874 aa  683    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 880 aa  738    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 874 aa  726    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 874 aa  738    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 874 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 876 aa  716    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 874 aa  690    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0421  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 882 aa  657    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 886 aa  692    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 867 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 897 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 885 aa  735    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 878 aa  696    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 874 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 874 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 863 aa  709    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 878 aa  734    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 872 aa  671    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>