More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7968 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  100 
 
 		 338 aa  683    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  62.97 
 
 		 334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  54.84 
 
 		 328 aa  308  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  41.14 
 
 		 348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  36.36 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  38.59 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2234  Peptidase M23  32.01 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.417932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2172  Peptidase M23  32.01 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  35.52 
 
 		 599 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  44.05 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  37.5 
 
 		 374 aa  67  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  36.9 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  32.91 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  39.51 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  50.77 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  32.91 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  35.51 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  32.05 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  39.05 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  33.54 
 
 		 592 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  34.58 
 
 		 420 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  37.23 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  28.8 
 
 		 630 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  37.23 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0261  M23 peptidase domain protein  33.61 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0566048  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  38.1 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  45.21 
 
 		 569 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  36.52 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  36.84 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  34.42 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  43.2 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  36.84 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  33.33 
 
 		 437 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  33.33 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  45.45 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  34.75 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  46.15 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  33.61 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  38.95 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  35.94 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  39.64 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  41.79 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  39.81 
 
 		 610 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  40.91 
 
 		 439 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  41.84 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  41.84 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  31.76 
 
 		 597 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  38.75 
 
 		 375 aa  59.3  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.13 
 
 		 268 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.07 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  38.82 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  38.82 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  38.82 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  40.48 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  35.71 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  40.3 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  32.48 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  34.65 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  36.84 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  31.97 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.77 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  37.3 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  35.07 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  32.38 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  37.82 
 
 		 550 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  31.93 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  40.91 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  35.14 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.42 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  30.51 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.86 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.94 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33.61 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  40 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  42.11 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  31.4 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  46.97 
 
 		 669 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  31.93 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  45.45 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  45.45 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48550  peptidase M23B family protein  39 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  45.45 
 
 		 319 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  36.89 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  39.76 
 
 		 277 aa  57  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.45 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  41.54 
 
 		 649 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1247  Peptidase M23  47.22 
 
 		 791 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  38.81 
 
 		 453 aa  57  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  40.91 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  41.54 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  41.56 
 
 		 389 aa  57  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  48.53 
 
 		 266 aa  57  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  35.66 
 
 		 464 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  38.82 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  41.56 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  28.46 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  30 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  43.53 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  34.95 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  34.45 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>