More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4002 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  100 
 
 
328 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  54.6 
 
 
334 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  53.52 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  45.03 
 
 
348 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  36.2 
 
 
351 aa  215  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2234  Peptidase M23  33.65 
 
 
342 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.417932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2172  Peptidase M23  33.65 
 
 
342 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  41.3 
 
 
360 aa  209  7e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  39.83 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  36.31 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  38.38 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.82 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  38.38 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  39.83 
 
 
669 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  43.27 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  35.88 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4738  peptidase M23B  38.19 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000208513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4302  peptidase M23B  38.81 
 
 
387 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.416455  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  38.95 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  38.05 
 
 
300 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  34.17 
 
 
430 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  40.54 
 
 
243 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  31.3 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  35.54 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  50.77 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  33.64 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  39.22 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.24 
 
 
323 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  38.95 
 
 
404 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  44.62 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  34.71 
 
 
486 aa  63.9  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  36.63 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  34.45 
 
 
325 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  36.13 
 
 
301 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  38.38 
 
 
454 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.09 
 
 
569 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  46.97 
 
 
377 aa  63.2  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  37.65 
 
 
363 aa  62.8  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  32.35 
 
 
527 aa  62.8  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  33.9 
 
 
450 aa  62.4  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  34.75 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  35.59 
 
 
442 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  43.88 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  47.89 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  36.8 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  33.87 
 
 
293 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  44.62 
 
 
414 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  31.67 
 
 
255 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  36.13 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  44.62 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  32.14 
 
 
268 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  35.83 
 
 
453 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  44.93 
 
 
374 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  40.43 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  34.33 
 
 
464 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  39.76 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  44.62 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  42.86 
 
 
491 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  33.05 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  35.92 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  35.92 
 
 
321 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  31.76 
 
 
630 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  34.4 
 
 
460 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  43.82 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  41.18 
 
 
440 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  37.7 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  42.42 
 
 
482 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  36.44 
 
 
290 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  41.18 
 
 
437 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  35.92 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  41.18 
 
 
440 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  32.79 
 
 
621 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  33.05 
 
 
333 aa  60.5  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.79 
 
 
375 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  36.97 
 
 
284 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  34.15 
 
 
399 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1351  Peptidase M23  37.31 
 
 
467 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.749113  hitchhiker  0.00315116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.62 
 
 
229 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  39.6 
 
 
238 aa  59.7  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00220  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.94 
 
 
554 aa  60.1  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  32.23 
 
 
470 aa  59.7  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.29 
 
 
524 aa  59.7  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  47.76 
 
 
402 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  41.18 
 
 
429 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  46.15 
 
 
277 aa  59.7  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6142  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0464  peptidase M23B  38.24 
 
 
484 aa  59.7  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.56 
 
 
273 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  34.75 
 
 
349 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  34.59 
 
 
231 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  32.56 
 
 
244 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70780  hypothetical protein  31.58 
 
 
299 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.848669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3052  Peptidase M23  33.06 
 
 
297 aa  59.3  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.346381  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  32.5 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 
295 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  39.8 
 
 
464 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  35.29 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  30.6 
 
 
640 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  35.29 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  31.97 
 
 
615 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>