More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1660 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1660  peptidase M23B  100 
 
 		 348 aa  703    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4002  peptidase M23B  43.05 
 
 		 328 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2234  Peptidase M23  36.33 
 
 		 342 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.417932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2172  Peptidase M23  36.33 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0115  Peptidase M23  39.18 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7968  Peptidase M23  41.14 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2558  peptidase M23B  37.5 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1705  Peptidase M23  36.92 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  38.32 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  36.03 
 
 		 290 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0711  Peptidase M23  40.86 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.324034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1743  peptidase M23B  41.84 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.127789  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  39.73 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0377  Peptidase M23  38.89 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  39.73 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  35.21 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  35.42 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  39.73 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  38.1 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  39.73 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  39.73 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  34.72 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.73 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  39.73 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  39.05 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  34.03 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2926  Peptidase M23  36.17 
 
 		 502 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.902001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2837  Peptidase M23  37.36 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000204146  normal  0.0350761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  34.45 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.8 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  48.21 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  37.8 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  41.18 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  41.18 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  41.18 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  37.8 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  37.8 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  36.08 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2233  peptidase M23B  32.29 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2272  peptidase M23B  32.29 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  29.81 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  33.61 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5480  peptidase, M23/M37 family  37.11 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  39.05 
 
 		 439 aa  59.3  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  35.04 
 
 		 482 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  46.27 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  36.08 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  38.16 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  38.16 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3591  peptidase M23B  40 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  42.42 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  43.28 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  32.43 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2234  peptidase M23B  32 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  35.29 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  34.86 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  38.68 
 
 		 430 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3642  Peptidase M23  39.77 
 
 		 339 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  41.79 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  44.78 
 
 		 456 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4198  peptidase M23B  42.19 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.354904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  39.71 
 
 		 429 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  44.78 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2536  Peptidase M23  36 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  49.12 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01679  peptidase  35.48 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0185  peptidase M23B  44.26 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5370  peptidase M23B  35.05 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5428  Peptidase M23  36.36 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  41.79 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44.78 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  33.61 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  36.28 
 
 		 633 aa  56.2  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  38.67 
 
 		 512 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2599  peptidase M23  41.94 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12860  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.44 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  38.67 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  35.83 
 
 		 268 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  38.67 
 
 		 470 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  43.28 
 
 		 454 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  38.67 
 
 		 509 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  50 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  43.28 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  38.67 
 
 		 471 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0151  peptidase M23B  34.74 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  33 
 
 		 537 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  30.14 
 
 		 592 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  28.14 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.29 
 
 		 471 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  41.18 
 
 		 293 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  38.81 
 
 		 447 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  32.98 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  45.31 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  50.85 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  43.28 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  38.67 
 
 		 499 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  42.42 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  47.37 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  44.62 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  30.29 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>