More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4520 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  53.31 
 
 		 1032 aa  992    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.71 
 
 		 1028 aa  881    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  65.6 
 
 		 1052 aa  1283    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  68.99 
 
 		 1055 aa  1221    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.2 
 
 		 1061 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  91.86 
 
 		 1064 aa  1790    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  71.37 
 
 		 1061 aa  1321    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1064 aa  2051    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  50.54 
 
 		 1039 aa  926    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  71.41 
 
 		 1054 aa  1380    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  48.02 
 
 		 1046 aa  900    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  98.21 
 
 		 1064 aa  2017    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.03 
 
 		 1071 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  37.7 
 
 		 1041 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  39.74 
 
 		 1023 aa  622  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1054 aa  611  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.15 
 
 		 1066 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.85 
 
 		 1066 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 		 1050 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.04 
 
 		 1054 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.79 
 
 		 1053 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.31 
 
 		 1092 aa  586  1e-166  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  37.4 
 
 		 1034 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  38.67 
 
 		 1045 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  36.25 
 
 		 1039 aa  581  1e-164  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  37.41 
 
 		 1040 aa  572  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.95 
 
 		 1034 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  36.39 
 
 		 1036 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  40.12 
 
 		 1033 aa  562  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.19 
 
 		 1043 aa  562  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.35 
 
 		 1048 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1043 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.99 
 
 		 1026 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.33 
 
 		 1037 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  37.29 
 
 		 1031 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  35.93 
 
 		 1047 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.06 
 
 		 1049 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.37 
 
 		 1049 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.03 
 
 		 1037 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  35.62 
 
 		 1044 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  35.74 
 
 		 1043 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.97 
 
 		 1039 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  35.19 
 
 		 1039 aa  526  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  35.5 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.25 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.9 
 
 		 1049 aa  522  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.51 
 
 		 1039 aa  522  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  36.99 
 
 		 1058 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.51 
 
 		 1039 aa  522  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  36.86 
 
 		 1049 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  35.19 
 
 		 1039 aa  519  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  36.8 
 
 		 1066 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.09 
 
 		 1048 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.29 
 
 		 1039 aa  518  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1052 aa  517  1.0000000000000001e-145  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1075 aa  516  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 		 1058 aa  512  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  34.68 
 
 		 1057 aa  511  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  41.57 
 
 		 1034 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  36.35 
 
 		 1047 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  39.63 
 
 		 1030 aa  477  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  32.15 
 
 		 1065 aa  474  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.93 
 
 		 1020 aa  469  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  32.17 
 
 		 1069 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4441  CzcA family heavy metal efflux protein  29.97 
 
 		 1017 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.883147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.24 
 
 		 1049 aa  462  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  29.87 
 
 		 1017 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4246  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.97 
 
 		 1017 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  29.97 
 
 		 1017 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  32.33 
 
 		 1029 aa  459  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  31.41 
 
 		 1066 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  31.64 
 
 		 1033 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  32.87 
 
 		 1046 aa  449  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  30.33 
 
 		 1017 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  29.64 
 
 		 1017 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  29.64 
 
 		 1017 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3766  CzcA family heavy metal efflux protein  31.12 
 
 		 1017 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  32.03 
 
 		 1053 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  31.57 
 
 		 1049 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  31.7 
 
 		 1054 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  31.38 
 
 		 1028 aa  446  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  29.64 
 
 		 1017 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  31.7 
 
 		 1069 aa  446  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  31.64 
 
 		 1040 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  31.18 
 
 		 1053 aa  443  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  31.18 
 
 		 1053 aa  443  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.59 
 
 		 1064 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  31.09 
 
 		 1053 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  32.6 
 
 		 1032 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  31.5 
 
 		 1051 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  31.18 
 
 		 1053 aa  443  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  31.61 
 
 		 1050 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  31.61 
 
 		 1072 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.91 
 
 		 1034 aa  436  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.17 
 
 		 1047 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0204  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.08 
 
 		 1034 aa  435  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.48458  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  31.2 
 
 		 1052 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  30.57 
 
 		 1064 aa  432  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  32.68 
 
 		 1066 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  31.02 
 
 		 1044 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>