More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2735 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  42.51 
 
 		 1054 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1034 aa  1946    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  41.89 
 
 		 1052 aa  644    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  42.84 
 
 		 1032 aa  679    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  42.26 
 
 		 1039 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  75.68 
 
 		 1033 aa  1354    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  38.38 
 
 		 1046 aa  631  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  43.64 
 
 		 1061 aa  629  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  41.53 
 
 		 1064 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.37 
 
 		 1028 aa  602  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  41.72 
 
 		 1064 aa  602  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  41.57 
 
 		 1064 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  42.43 
 
 		 1055 aa  569  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  36.16 
 
 		 1045 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  35.49 
 
 		 1036 aa  502  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  35.03 
 
 		 1023 aa  490  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 		 1054 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.41 
 
 		 1092 aa  480  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.4 
 
 		 1061 aa  479  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  30.01 
 
 		 1071 aa  475  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  32.98 
 
 		 1034 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  35.27 
 
 		 1043 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  30.72 
 
 		 1066 aa  462  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  30.62 
 
 		 1066 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.32 
 
 		 1054 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  36.24 
 
 		 1043 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.92 
 
 		 1034 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  34.71 
 
 		 1031 aa  458  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.08 
 
 		 1053 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.78 
 
 		 1048 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  31.74 
 
 		 1039 aa  449  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1066 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.01 
 
 		 1039 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  34.03 
 
 		 1058 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.81 
 
 		 1039 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.37 
 
 		 1049 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  32.68 
 
 		 1041 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  34.22 
 
 		 1050 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  31.88 
 
 		 1039 aa  432  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.65 
 
 		 1049 aa  432  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.19 
 
 		 1026 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.35 
 
 		 1037 aa  432  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.36 
 
 		 1039 aa  432  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.38 
 
 		 1037 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1058 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  33.23 
 
 		 1075 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.84 
 
 		 1049 aa  429  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  31.69 
 
 		 1039 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  34.42 
 
 		 1049 aa  423  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.2 
 
 		 1039 aa  422  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1052 aa  421  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.2 
 
 		 1039 aa  422  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  33.27 
 
 		 1047 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  33.57 
 
 		 1047 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1040 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  31.77 
 
 		 1043 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  30.74 
 
 		 1039 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  32 
 
 		 1048 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  32.51 
 
 		 1057 aa  399  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.01 
 
 		 1047 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  31.98 
 
 		 1077 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  31.03 
 
 		 1062 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  30.4 
 
 		 1083 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.75 
 
 		 1034 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08540  heavy metal efflux pump CzcA family  32.95 
 
 		 1074 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.429916  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  31.39 
 
 		 1077 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  29.26 
 
 		 1065 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  29.28 
 
 		 1040 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  31.47 
 
 		 1077 aa  380  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  30.31 
 
 		 1029 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  31.47 
 
 		 1077 aa  380  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  28.72 
 
 		 1032 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.04 
 
 		 1064 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  31.37 
 
 		 1077 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  31.47 
 
 		 1077 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  31.47 
 
 		 1077 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  31.47 
 
 		 1077 aa  376  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  30.65 
 
 		 1070 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  29.41 
 
 		 1082 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  29.55 
 
 		 1069 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  29.3 
 
 		 1074 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  30.8 
 
 		 1070 aa  366  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.56 
 
 		 1052 aa  366  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  30.36 
 
 		 1043 aa  366  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  30.69 
 
 		 1070 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  29.81 
 
 		 1066 aa  365  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  29.83 
 
 		 1070 aa  365  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  30.44 
 
 		 1040 aa  364  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  27.41 
 
 		 1034 aa  364  6e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  29.08 
 
 		 1076 aa  362  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  29.87 
 
 		 1070 aa  363  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  30.59 
 
 		 1070 aa  363  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  30.59 
 
 		 1070 aa  363  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  29.23 
 
 		 1054 aa  362  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  29.56 
 
 		 1046 aa  362  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  29.84 
 
 		 1038 aa  361  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  29.06 
 
 		 1049 aa  361  4e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  29.33 
 
 		 1047 aa  361  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  29.96 
 
 		 1070 aa  360  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  30.27 
 
 		 1059 aa  360  8e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>