More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1746 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  61.79 
 
 		 1039 aa  1278    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  45.07 
 
 		 1023 aa  863    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  60.43 
 
 		 1039 aa  1231    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  45.81 
 
 		 1039 aa  874    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  37.16 
 
 		 1052 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 		 1032 aa  653    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.45 
 
 		 1092 aa  991    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.08 
 
 		 1054 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  61.87 
 
 		 1037 aa  1236    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  41.26 
 
 		 1066 aa  793    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.51 
 
 		 1071 aa  799    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  41.82 
 
 		 1066 aa  799    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  59.18 
 
 		 1058 aa  1185    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  61.31 
 
 		 1075 aa  1239    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  61.18 
 
 		 1039 aa  1241    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  59.54 
 
 		 1058 aa  1183    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.15 
 
 		 1034 aa  843    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  38.71 
 
 		 1036 aa  683    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 		 1034 aa  2065    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  63.95 
 
 		 1047 aa  1325    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  62.91 
 
 		 1048 aa  1281    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  44.25 
 
 		 1041 aa  820    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  60.46 
 
 		 1039 aa  1236    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  60.66 
 
 		 1039 aa  1246    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  62.54 
 
 		 1049 aa  1258    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  45.88 
 
 		 1045 aa  888    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  61.12 
 
 		 1043 aa  1251    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.86 
 
 		 1053 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.84 
 
 		 1026 aa  783    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  62.64 
 
 		 1043 aa  1278    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  63.21 
 
 		 1049 aa  1251    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  60.02 
 
 		 1048 aa  1212    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  60.92 
 
 		 1039 aa  1251    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  60.8 
 
 		 1037 aa  1214    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  63.62 
 
 		 1043 aa  1302    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  60.92 
 
 		 1039 aa  1251    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  62.73 
 
 		 1049 aa  1237    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  61.23 
 
 		 1039 aa  1261    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  59.75 
 
 		 1066 aa  1189    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  42.53 
 
 		 1040 aa  785    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  62.25 
 
 		 1031 aa  1251    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  44.03 
 
 		 1030 aa  698    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  62.1 
 
 		 1047 aa  1211    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.62 
 
 		 1061 aa  763    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  62.73 
 
 		 1049 aa  1282    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  36.15 
 
 		 1046 aa  618  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.56 
 
 		 1052 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  38.16 
 
 		 1039 aa  595  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  37.38 
 
 		 1054 aa  588  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  35.04 
 
 		 1054 aa  588  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.78 
 
 		 1077 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  34.16 
 
 		 1051 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.78 
 
 		 1077 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  34.68 
 
 		 1077 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.59 
 
 		 1077 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  34.68 
 
 		 1077 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.78 
 
 		 1077 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.96 
 
 		 1077 aa  581  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  34.68 
 
 		 1077 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.7 
 
 		 1070 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  35.91 
 
 		 1075 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.51 
 
 		 1070 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  34.48 
 
 		 1050 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  34.1 
 
 		 1070 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.42 
 
 		 1070 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  33.33 
 
 		 1053 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.34 
 
 		 1033 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.44 
 
 		 1049 aa  572  1e-161  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  33.49 
 
 		 1059 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.33 
 
 		 1053 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.9 
 
 		 1070 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  33.33 
 
 		 1053 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.59 
 
 		 1040 aa  570  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  34 
 
 		 1070 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34 
 
 		 1070 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  33.99 
 
 		 1083 aa  569  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.33 
 
 		 1053 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34 
 
 		 1070 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.09 
 
 		 1028 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  33.46 
 
 		 1053 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  32.96 
 
 		 1052 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  34.64 
 
 		 1029 aa  566  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.41 
 
 		 1082 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  33.27 
 
 		 1040 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.79 
 
 		 1076 aa  568  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.11 
 
 		 1066 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  33.78 
 
 		 1047 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.42 
 
 		 1065 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  35.47 
 
 		 1074 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  32.47 
 
 		 1043 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  35.94 
 
 		 1075 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  35.75 
 
 		 1068 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  33.05 
 
 		 1054 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  33.98 
 
 		 1046 aa  559  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  34.06 
 
 		 1048 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  35.75 
 
 		 1068 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  35.34 
 
 		 1069 aa  562  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.87 
 
 		 1052 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  33.97 
 
 		 1048 aa  559  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  34.63 
 
 		 1076 aa  559  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>