More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5032 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.9 
 
 		 1028 aa  883    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  72.08 
 
 		 1054 aa  1387    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  92.84 
 
 		 1064 aa  1772    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1064 aa  2057    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  37.99 
 
 		 1041 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  53.32 
 
 		 1032 aa  985    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  93.29 
 
 		 1064 aa  1760    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  50.78 
 
 		 1039 aa  913    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  47.88 
 
 		 1046 aa  904    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  70.48 
 
 		 1055 aa  1219    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  71.54 
 
 		 1061 aa  1324    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  65.41 
 
 		 1052 aa  1290    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  35.5 
 
 		 1071 aa  630  1e-179  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  38.61 
 
 		 1023 aa  619  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.43 
 
 		 1061 aa  611  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.15 
 
 		 1066 aa  608  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.07 
 
 		 1066 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  36.92 
 
 		 1054 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  39.31 
 
 		 1045 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  36.69 
 
 		 1050 aa  592  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.54 
 
 		 1092 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  35.64 
 
 		 1039 aa  589  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.07 
 
 		 1053 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.49 
 
 		 1054 aa  582  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  37.13 
 
 		 1040 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  37.24 
 
 		 1034 aa  571  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  36.52 
 
 		 1036 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.67 
 
 		 1043 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.22 
 
 		 1034 aa  562  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1033 aa  555  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  37.16 
 
 		 1043 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.94 
 
 		 1037 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.35 
 
 		 1037 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.57 
 
 		 1026 aa  539  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  35.85 
 
 		 1047 aa  535  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.4 
 
 		 1048 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  34.51 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.51 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  35.43 
 
 		 1043 aa  520  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 		 1031 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.47 
 
 		 1049 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.91 
 
 		 1049 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  36.27 
 
 		 1058 aa  515  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  35.08 
 
 		 1044 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 		 1057 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  41.85 
 
 		 1034 aa  511  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  35.37 
 
 		 1075 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  36.07 
 
 		 1066 aa  512  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  36.33 
 
 		 1058 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.82 
 
 		 1039 aa  512  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.82 
 
 		 1039 aa  512  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.24 
 
 		 1039 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.5 
 
 		 1039 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  34.15 
 
 		 1039 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  36.33 
 
 		 1049 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  34.34 
 
 		 1039 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.49 
 
 		 1048 aa  504  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.31 
 
 		 1049 aa  502  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1052 aa  493  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  35.75 
 
 		 1047 aa  489  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.82 
 
 		 1020 aa  475  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  39.34 
 
 		 1030 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.23 
 
 		 1049 aa  467  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  32.25 
 
 		 1029 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.1 
 
 		 1049 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  31.09 
 
 		 1065 aa  457  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  31.67 
 
 		 1033 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  31.51 
 
 		 1053 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  31.51 
 
 		 1053 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  33.24 
 
 		 1064 aa  452  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  32.05 
 
 		 1053 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  32.15 
 
 		 1054 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  33.37 
 
 		 1032 aa  452  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  31.33 
 
 		 1069 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  32.18 
 
 		 1050 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  31.51 
 
 		 1053 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  32.77 
 
 		 1046 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  29.68 
 
 		 1017 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  33.1 
 
 		 1032 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4441  CzcA family heavy metal efflux protein  29.68 
 
 		 1017 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.883147 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  32.4 
 
 		 1028 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4246  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.68 
 
 		 1017 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  31.41 
 
 		 1053 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  31.84 
 
 		 1069 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  31.03 
 
 		 1052 aa  446  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  29.91 
 
 		 1017 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  29.96 
 
 		 1037 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  30.48 
 
 		 1066 aa  442  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  31.73 
 
 		 1076 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  31.87 
 
 		 1051 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  33.21 
 
 		 1048 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  32.61 
 
 		 1066 aa  439  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  33.3 
 
 		 1048 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.47 
 
 		 1047 aa  439  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  31.62 
 
 		 1082 aa  439  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  31.16 
 
 		 1040 aa  439  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  31.36 
 
 		 1072 aa  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  33.21 
 
 		 1048 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  29.59 
 
 		 1017 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  30.12 
 
 		 1037 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>