More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2183 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  36.94 
 
 		 1052 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  49.38 
 
 		 1044 aa  990    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  38.18 
 
 		 1054 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  59.6 
 
 		 1050 aa  1206    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1054 aa  2117    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  39.52 
 
 		 1039 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  48 
 
 		 1057 aa  929    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  37.94 
 
 		 1032 aa  633  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  39.18 
 
 		 1061 aa  628  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  36.83 
 
 		 1039 aa  615  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  34.01 
 
 		 1071 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  37.81 
 
 		 1045 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  34.63 
 
 		 1066 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  34.48 
 
 		 1066 aa  602  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  36.43 
 
 		 1046 aa  597  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.12 
 
 		 1061 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  35.04 
 
 		 1034 aa  587  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.45 
 
 		 1028 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1064 aa  581  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 		 1064 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.32 
 
 		 1048 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.68 
 
 		 1049 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  35.51 
 
 		 1043 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.78 
 
 		 1049 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.7 
 
 		 1039 aa  572  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.27 
 
 		 1039 aa  571  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  36.92 
 
 		 1064 aa  567  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  35.85 
 
 		 1041 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  34.87 
 
 		 1023 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  34.51 
 
 		 1039 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  36.26 
 
 		 1047 aa  565  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  34.69 
 
 		 1036 aa  562  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.29 
 
 		 1039 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.29 
 
 		 1039 aa  561  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.32 
 
 		 1039 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.41 
 
 		 1048 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  36.01 
 
 		 1043 aa  559  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  33.62 
 
 		 1039 aa  556  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  35.07 
 
 		 1043 aa  558  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 		 1031 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.97 
 
 		 1053 aa  556  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.91 
 
 		 1049 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.49 
 
 		 1092 aa  555  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.78 
 
 		 1054 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  33.78 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  35.36 
 
 		 1049 aa  544  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 		 1058 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 		 1066 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.69 
 
 		 1037 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  35.06 
 
 		 1075 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  36.29 
 
 		 1055 aa  538  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  35.24 
 
 		 1058 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  35.84 
 
 		 1047 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  34.72 
 
 		 1040 aa  522  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.11 
 
 		 1037 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.24 
 
 		 1034 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.34 
 
 		 1026 aa  503  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1052 aa  478  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  35.99 
 
 		 1030 aa  466  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  29.82 
 
 		 1064 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.19 
 
 		 1049 aa  441  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1033 aa  439  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  29.66 
 
 		 1065 aa  439  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  28.77 
 
 		 1066 aa  432  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  28.61 
 
 		 1082 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  28.57 
 
 		 1053 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  28.57 
 
 		 1053 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  28.02 
 
 		 1059 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  29.62 
 
 		 1029 aa  429  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  29.66 
 
 		 1069 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  28.57 
 
 		 1053 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  28.69 
 
 		 1074 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  28.77 
 
 		 1054 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  28.16 
 
 		 1076 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  28.7 
 
 		 1066 aa  425  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  29.2 
 
 		 1075 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  28.48 
 
 		 1053 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  29.1 
 
 		 1068 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  29.17 
 
 		 1062 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  28.92 
 
 		 1075 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  28.92 
 
 		 1068 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  28.73 
 
 		 1033 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  29.23 
 
 		 1049 aa  422  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.35 
 
 		 1052 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  28.92 
 
 		 1068 aa  423  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  28.72 
 
 		 1062 aa  418  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  29.28 
 
 		 1032 aa  419  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.92 
 
 		 1068 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1466  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.94 
 
 		 1042 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  28.43 
 
 		 1076 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  28.64 
 
 		 1070 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  28.79 
 
 		 1070 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  27.22 
 
 		 1053 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.66 
 
 		 1020 aa  415  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  28.8 
 
 		 1048 aa  416  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  28.79 
 
 		 1070 aa  416  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  27.12 
 
 		 1054 aa  413  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.11 
 
 		 1062 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.57 
 
 		 1462 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  27.67 
 
 		 1050 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>