More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1887 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  45.24 
 
 		 1023 aa  838    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  45.75 
 
 		 1039 aa  872    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.87 
 
 		 1048 aa  1101    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.41 
 
 		 1034 aa  752    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  68.56 
 
 		 1031 aa  1343    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  56.02 
 
 		 1039 aa  1134    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.35 
 
 		 1049 aa  1335    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.3 
 
 		 1026 aa  749    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  68.45 
 
 		 1049 aa  1307    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  41.35 
 
 		 1066 aa  755    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.72 
 
 		 1071 aa  762    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  41.53 
 
 		 1066 aa  756    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.92 
 
 		 1053 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  55.01 
 
 		 1039 aa  1129    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  56.01 
 
 		 1039 aa  1121    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  40.18 
 
 		 1036 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  61.87 
 
 		 1034 aa  1276    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  68.16 
 
 		 1043 aa  1358    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  44.47 
 
 		 1041 aa  796    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.44 
 
 		 1039 aa  1120    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1037 aa  2020    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  65.2 
 
 		 1058 aa  1242    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  64.86 
 
 		 1075 aa  1269    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  65.58 
 
 		 1066 aa  1276    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  59.15 
 
 		 1043 aa  1160    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  46.86 
 
 		 1045 aa  840    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.65 
 
 		 1039 aa  1126    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.65 
 
 		 1039 aa  1126    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.99 
 
 		 1092 aa  908    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  67.57 
 
 		 1048 aa  1365    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.06 
 
 		 1049 aa  1363    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  66.99 
 
 		 1043 aa  1310    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  60.97 
 
 		 1047 aa  1188    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  45.55 
 
 		 1030 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.86 
 
 		 1061 aa  742    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  67.28 
 
 		 1047 aa  1292    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  95.37 
 
 		 1037 aa  1850    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  56.49 
 
 		 1039 aa  1130    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  65.87 
 
 		 1058 aa  1282    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  44.77 
 
 		 1040 aa  751    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  56.59 
 
 		 1039 aa  1115    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.55 
 
 		 1049 aa  1315    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.34 
 
 		 1054 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  36.02 
 
 		 1052 aa  632  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  40.14 
 
 		 1032 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  38.08 
 
 		 1046 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  39.69 
 
 		 1052 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  35.68 
 
 		 1051 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  40.02 
 
 		 1054 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  33.9 
 
 		 1052 aa  585  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  34.95 
 
 		 1053 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  33.3 
 
 		 1049 aa  580  1e-164  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.32 
 
 		 1052 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  34.69 
 
 		 1054 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  34.44 
 
 		 1070 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  33.62 
 
 		 1059 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  35.01 
 
 		 1043 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.19 
 
 		 1064 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  34.5 
 
 		 1050 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.86 
 
 		 1065 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  34.44 
 
 		 1070 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34.44 
 
 		 1070 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  35.36 
 
 		 1048 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34.44 
 
 		 1070 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.42 
 
 		 1077 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  34.42 
 
 		 1053 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  35.36 
 
 		 1048 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  35.27 
 
 		 1048 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.42 
 
 		 1077 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.51 
 
 		 1053 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.42 
 
 		 1053 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  34.42 
 
 		 1053 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  35.38 
 
 		 1069 aa  572  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.42 
 
 		 1077 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  34.35 
 
 		 1070 aa  572  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.17 
 
 		 1062 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.25 
 
 		 1046 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  35.14 
 
 		 1048 aa  566  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  39.2 
 
 		 1039 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35.23 
 
 		 1077 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  35.23 
 
 		 1077 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35.23 
 
 		 1077 aa  567  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.13 
 
 		 1063 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.72 
 
 		 1062 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.14 
 
 		 1077 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  34.08 
 
 		 1061 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  34.11 
 
 		 1062 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  34.04 
 
 		 1063 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  36.18 
 
 		 1066 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1054 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  33.96 
 
 		 1075 aa  558  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  40.68 
 
 		 1061 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.69 
 
 		 1077 aa  559  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  35.38 
 
 		 1046 aa  553  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1466  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.63 
 
 		 1042 aa  555  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.04 
 
 		 1040 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  33.11 
 
 		 1040 aa  556  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.48 
 
 		 1034 aa  554  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  33.97 
 
 		 1034 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08540  heavy metal efflux pump CzcA family  36.49 
 
 		 1074 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.429916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>