More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1329 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  42.86 
 
 
1023 aa  822    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.44 
 
 
1049 aa  1118    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  43.34 
 
 
1039 aa  810    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  58.41 
 
 
1043 aa  1193    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.86 
 
 
1049 aa  1085    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  52.79 
 
 
1066 aa  1038    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.62 
 
 
1039 aa  1808    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40 
 
 
1066 aa  728    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.07 
 
 
1071 aa  736    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.62 
 
 
1039 aa  1808    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.38 
 
 
1066 aa  733    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  55.99 
 
 
1031 aa  1096    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  55.92 
 
 
1043 aa  1125    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  86.72 
 
 
1039 aa  1797    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  52.5 
 
 
1058 aa  1030    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  81.49 
 
 
1048 aa  1706    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  37.84 
 
 
1036 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  61.23 
 
 
1034 aa  1263    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.67 
 
 
1037 aa  1070    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  42.63 
 
 
1041 aa  756    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  55.86 
 
 
1049 aa  1075    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.42 
 
 
1054 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.62 
 
 
1026 aa  738    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  84.89 
 
 
1039 aa  1774    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  54.84 
 
 
1075 aa  1083    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.61 
 
 
1053 aa  680    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.49 
 
 
1037 aa  1092    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  55.43 
 
 
1043 aa  1093    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  59.19 
 
 
1047 aa  1206    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  52.78 
 
 
1058 aa  1015    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  84.22 
 
 
1039 aa  1760    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  41.07 
 
 
1030 aa  636    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.74 
 
 
1092 aa  890    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.31 
 
 
1061 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.2 
 
 
1034 aa  744    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  91.34 
 
 
1039 aa  1883    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.54 
 
 
1048 aa  1129    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  42.33 
 
 
1040 aa  734    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 
1039 aa  2060    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  55.72 
 
 
1047 aa  1071    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  96.63 
 
 
1039 aa  1965    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  43.93 
 
 
1045 aa  831    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.44 
 
 
1049 aa  1108    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  36.57 
 
 
1052 aa  628  1e-178  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.9 
 
 
1065 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  34.57 
 
 
1043 aa  596  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.66 
 
 
1033 aa  595  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.89 
 
 
1029 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  36.28 
 
 
1069 aa  592  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  34.26 
 
 
1070 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.15 
 
 
1063 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34.26 
 
 
1070 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.02 
 
 
1064 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  33.83 
 
 
1077 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.87 
 
 
1070 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  33.83 
 
 
1077 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.89 
 
 
1077 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  34.26 
 
 
1070 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  33.83 
 
 
1077 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  34.15 
 
 
1063 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34.26 
 
 
1070 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  33.65 
 
 
1077 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  33.55 
 
 
1077 aa  579  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  33.65 
 
 
1077 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  33.65 
 
 
1077 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  34.16 
 
 
1053 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.16 
 
 
1053 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.16 
 
 
1053 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  34.16 
 
 
1053 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  36.04 
 
 
1032 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.97 
 
 
1082 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.75 
 
 
1062 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 
1066 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.11 
 
 
1052 aa  572  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  33.84 
 
 
1059 aa  570  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.09 
 
 
1040 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  35.46 
 
 
1031 aa  571  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  36.28 
 
 
1023 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.5 
 
 
1070 aa  567  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 
1054 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  33.75 
 
 
1040 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.52 
 
 
1076 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  34.85 
 
 
1034 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.58 
 
 
1049 aa  564  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  35.43 
 
 
1068 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  33.74 
 
 
1064 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.42 
 
 
1062 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  35.81 
 
 
1075 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  36.63 
 
 
1032 aa  562  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  37.18 
 
 
1038 aa  562  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  35.34 
 
 
1068 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  33.56 
 
 
1051 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.55 
 
 
1068 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  34.16 
 
 
1032 aa  562  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  34.44 
 
 
1062 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  35.19 
 
 
1048 aa  561  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  34.54 
 
 
1076 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 
1070 aa  562  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.64 
 
 
1070 aa  562  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  35.43 
 
 
1068 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>