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for query gene Plim_0669 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.3 
 
 		 1039 aa  890    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  44.25 
 
 		 1066 aa  815    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.24 
 
 		 1034 aa  775    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  43.49 
 
 		 1023 aa  847    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  47.98 
 
 		 1043 aa  915    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  43.3 
 
 		 1039 aa  823    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.46 
 
 		 1039 aa  877    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  46.7 
 
 		 1043 aa  917    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  46.63 
 
 		 1047 aa  911    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  47.13 
 
 		 1047 aa  836    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  47.43 
 
 		 1048 aa  895    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1092 aa  2198    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.25 
 
 		 1026 aa  738    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  46.67 
 
 		 1031 aa  877    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.25 
 
 		 1066 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.91 
 
 		 1071 aa  767    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.52 
 
 		 1066 aa  732    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.76 
 
 		 1037 aa  858    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.94 
 
 		 1054 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  44.96 
 
 		 1045 aa  855    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  44.57 
 
 		 1039 aa  888    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.99 
 
 		 1037 aa  865    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 		 1052 aa  653    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  39.77 
 
 		 1036 aa  739    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  43.74 
 
 		 1039 aa  879    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  48.45 
 
 		 1034 aa  984    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.35 
 
 		 1053 aa  747    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  44.57 
 
 		 1058 aa  811    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  42.1 
 
 		 1041 aa  807    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.84 
 
 		 1049 aa  860    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  47.73 
 
 		 1049 aa  859    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  38.64 
 
 		 1032 aa  667    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.3 
 
 		 1039 aa  892    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  41.63 
 
 		 1030 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.3 
 
 		 1039 aa  892    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  47.15 
 
 		 1075 aa  883    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  44.71 
 
 		 1058 aa  828    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.7 
 
 		 1049 aa  869    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  43.63 
 
 		 1039 aa  875    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.21 
 
 		 1061 aa  798    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  39.51 
 
 		 1040 aa  692    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  46.31 
 
 		 1043 aa  867    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.6 
 
 		 1048 aa  877    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.37 
 
 		 1039 aa  891    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.89 
 
 		 1049 aa  886    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.13 
 
 		 1052 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 		 1046 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  34.67 
 
 		 1051 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.75 
 
 		 1065 aa  596  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  36.66 
 
 		 1039 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.58 
 
 		 1052 aa  595  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  33.21 
 
 		 1049 aa  589  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  34.44 
 
 		 1040 aa  587  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  34.89 
 
 		 1029 aa  588  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
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NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.68 
 
 		 1063 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  34.4 
 
 		 1033 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  33.8 
 
 		 1047 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
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NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  33.58 
 
 		 1063 aa  581  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
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NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  32.31 
 
 		 1053 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  34.44 
 
 		 1066 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  32.31 
 
 		 1053 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  33.14 
 
 		 1040 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  32.75 
 
 		 1069 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.58 
 
 		 1043 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  32.31 
 
 		 1053 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  34.68 
 
 		 1074 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.03 
 
 		 1069 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  33.86 
 
 		 1064 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.42 
 
 		 1070 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  32.89 
 
 		 1031 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  33.21 
 
 		 1069 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  32.93 
 
 		 1072 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  32.22 
 
 		 1053 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  33.33 
 
 		 1032 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.33 
 
 		 1028 aa  572  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  33.12 
 
 		 1052 aa  572  1e-161  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  34.33 
 
 		 1048 aa  572  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  33.05 
 
 		 1050 aa  572  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.61 
 
 		 1070 aa  571  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  33.58 
 
 		 1070 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  33.67 
 
 		 1070 aa  572  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  33.58 
 
 		 1070 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.04 
 
 		 1070 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  33.58 
 
 		 1070 aa  569  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  32.86 
 
 		 1062 aa  569  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  32.65 
 
 		 1059 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  34 
 
 		 1062 aa  569  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  33.8 
 
 		 1077 aa  569  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.16 
 
 		 1022 aa  569  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  32.37 
 
 		 1043 aa  568  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  33.49 
 
 		 1083 aa  568  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  33.52 
 
 		 1061 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.04 
 
 		 1070 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  33.15 
 
 		 1077 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.19 
 
 		 1066 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  34.04 
 
 		 1064 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  33.15 
 
 		 1077 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  32.56 
 
 		 1040 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  33.24 
 
 		 1077 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  33.24 
 
 		 1077 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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