More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0902 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  38 
 
 		 1032 aa  641    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  40.58 
 
 		 1023 aa  719    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  39.31 
 
 		 1049 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  40.12 
 
 		 1039 aa  726    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.17 
 
 		 1049 aa  659    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.68 
 
 		 1039 aa  676    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.14 
 
 		 1039 aa  694    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.68 
 
 		 1039 aa  688    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  44.84 
 
 		 1066 aa  871    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  45.35 
 
 		 1071 aa  898    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  44.99 
 
 		 1066 aa  878    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.81 
 
 		 1049 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  40.37 
 
 		 1043 aa  686    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  37.46 
 
 		 1039 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  39.96 
 
 		 1043 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  40.06 
 
 		 1075 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.37 
 
 		 1026 aa  679    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 		 1036 aa  2056    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  38.56 
 
 		 1034 aa  700    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  40.12 
 
 		 1041 aa  711    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.12 
 
 		 1037 aa  649    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.03 
 
 		 1048 aa  665    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  37.72 
 
 		 1039 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.75 
 
 		 1061 aa  809    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.59 
 
 		 1034 aa  731    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  40.71 
 
 		 1031 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.77 
 
 		 1054 aa  725    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  37.84 
 
 		 1039 aa  681    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  39.5 
 
 		 1058 aa  649    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.87 
 
 		 1053 aa  729    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.49 
 
 		 1049 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.81 
 
 		 1048 aa  676    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.14 
 
 		 1039 aa  694    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  38.51 
 
 		 1047 aa  665    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.77 
 
 		 1092 aa  762    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.31 
 
 		 1037 aa  660    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  39.31 
 
 		 1066 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  41.88 
 
 		 1045 aa  739    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.68 
 
 		 1039 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  40.08 
 
 		 1047 aa  635  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  37.57 
 
 		 1043 aa  631  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  37.3 
 
 		 1039 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  38.92 
 
 		 1058 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  37.1 
 
 		 1040 aa  623  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  35.63 
 
 		 1052 aa  608  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.48 
 
 		 1065 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  33.83 
 
 		 1064 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.89 
 
 		 1069 aa  586  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  34.18 
 
 		 1066 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.8 
 
 		 1033 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  39.71 
 
 		 1030 aa  576  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  34.69 
 
 		 1054 aa  575  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  36.16 
 
 		 1054 aa  572  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 		 1052 aa  569  1e-161  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  34.35 
 
 		 1074 aa  571  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  34.64 
 
 		 1070 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.74 
 
 		 1028 aa  569  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  34.93 
 
 		 1075 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  34.45 
 
 		 1070 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  34.86 
 
 		 1082 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  34.6 
 
 		 1075 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.24 
 
 		 1066 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  34.39 
 
 		 1070 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  34.05 
 
 		 1076 aa  559  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  33.52 
 
 		 1049 aa  562  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  35.05 
 
 		 1068 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  34.35 
 
 		 1076 aa  562  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.46 
 
 		 1052 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  34.95 
 
 		 1068 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.78 
 
 		 1063 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.79 
 
 		 1068 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  36.8 
 
 		 1061 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.37 
 
 		 1034 aa  558  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  34.95 
 
 		 1068 aa  559  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1046 aa  555  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  34.33 
 
 		 1062 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  33.68 
 
 		 1063 aa  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34.16 
 
 		 1064 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  33.27 
 
 		 1052 aa  552  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.3 
 
 		 1062 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  32.79 
 
 		 1032 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.98 
 
 		 1049 aa  546  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  35.53 
 
 		 1064 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  33.05 
 
 		 1034 aa  545  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  35.88 
 
 		 1064 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  32.87 
 
 		 1083 aa  544  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  34.81 
 
 		 1054 aa  545  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  36.17 
 
 		 1064 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  33.08 
 
 		 1051 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  34.74 
 
 		 1035 aa  542  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  32.93 
 
 		 1059 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.14 
 
 		 1022 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.9 
 
 		 1043 aa  542  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  33.21 
 
 		 1034 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  32.79 
 
 		 1053 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  33.02 
 
 		 1077 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  32.93 
 
 		 1077 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  32.93 
 
 		 1077 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  32.93 
 
 		 1077 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  33.33 
 
 		 1061 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>