More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0144 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  58.78 
 
 		 1047 aa  1111    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  44.85 
 
 		 1023 aa  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  59.15 
 
 		 1049 aa  1184    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  43.96 
 
 		 1039 aa  830    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  59.15 
 
 		 1039 aa  1214    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  59.68 
 
 		 1043 aa  1222    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  82.71 
 
 		 1043 aa  1702    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  59.19 
 
 		 1039 aa  1226    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  60 
 
 		 1037 aa  1152    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  59.02 
 
 		 1031 aa  1156    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.85 
 
 		 1066 aa  715    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.53 
 
 		 1071 aa  737    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.55 
 
 		 1066 aa  714    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.74 
 
 		 1054 aa  674    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.15 
 
 		 1053 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  58.71 
 
 		 1039 aa  1216    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  57.97 
 
 		 1039 aa  1214    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  58.59 
 
 		 1066 aa  1141    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  58.54 
 
 		 1048 aa  1188    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  38.29 
 
 		 1036 aa  663    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  63.95 
 
 		 1034 aa  1350    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  58.3 
 
 		 1058 aa  1134    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.51 
 
 		 1061 aa  750    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  44.47 
 
 		 1041 aa  806    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  58.28 
 
 		 1075 aa  1149    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  59.36 
 
 		 1039 aa  1227    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.63 
 
 		 1092 aa  938    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  44.5 
 
 		 1030 aa  693    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  59.52 
 
 		 1039 aa  1227    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  59.13 
 
 		 1043 aa  1180    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.93 
 
 		 1034 aa  776    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  59.69 
 
 		 1039 aa  1233    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  57.73 
 
 		 1058 aa  1117    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  59.81 
 
 		 1049 aa  1155    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 		 1047 aa  2076    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  57.87 
 
 		 1048 aa  1189    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  46.4 
 
 		 1045 aa  869    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  59.36 
 
 		 1039 aa  1227    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.35 
 
 		 1026 aa  751    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  43.47 
 
 		 1040 aa  762    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  60.97 
 
 		 1037 aa  1177    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  59.05 
 
 		 1049 aa  1139    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  60.14 
 
 		 1049 aa  1172    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1052 aa  601  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  37.79 
 
 		 1032 aa  600  1e-170  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.63 
 
 		 1052 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  36.26 
 
 		 1054 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  34.97 
 
 		 1046 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.56 
 
 		 1029 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  37.52 
 
 		 1039 aa  572  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  31.91 
 
 		 1049 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  35.31 
 
 		 1076 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.63 
 
 		 1082 aa  543  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.28 
 
 		 1066 aa  539  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  36.24 
 
 		 1054 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34.2 
 
 		 1064 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1050 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  33.87 
 
 		 1077 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  33.87 
 
 		 1077 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  33.87 
 
 		 1077 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.82 
 
 		 1052 aa  535  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  33.49 
 
 		 1083 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  33.87 
 
 		 1077 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  33.87 
 
 		 1077 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  33.87 
 
 		 1077 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.71 
 
 		 1063 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  32.48 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  33.65 
 
 		 1033 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  33.78 
 
 		 1077 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  32.57 
 
 		 1052 aa  532  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  32.48 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  32.48 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  33.62 
 
 		 1070 aa  532  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  32.48 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  31.62 
 
 		 1063 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  33.52 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  33.52 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  32.62 
 
 		 1059 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.14 
 
 		 1070 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  34.19 
 
 		 1040 aa  529  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  33.43 
 
 		 1070 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  34.51 
 
 		 1076 aa  528  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.28 
 
 		 1028 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  33.56 
 
 		 1048 aa  525  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  34.49 
 
 		 1070 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  32.35 
 
 		 1050 aa  526  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  32.99 
 
 		 1065 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  33.68 
 
 		 1077 aa  525  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  34.49 
 
 		 1070 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  32.29 
 
 		 1034 aa  522  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  33.46 
 
 		 1074 aa  521  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  32.76 
 
 		 1032 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  31.38 
 
 		 1040 aa  522  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1064 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  34.3 
 
 		 1070 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  34.1 
 
 		 1075 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  32.87 
 
 		 1061 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.89 
 
 		 1034 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.64 
 
 		 1034 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  31.41 
 
 		 1062 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>