More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0181 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  54.46 
 
 		 1039 aa  1100    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  36.85 
 
 		 1052 aa  638    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  42.79 
 
 		 1023 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  88.08 
 
 		 1031 aa  1762    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  44.31 
 
 		 1039 aa  833    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.89 
 
 		 1054 aa  687    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.53 
 
 		 1053 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  55.48 
 
 		 1039 aa  1097    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.46 
 
 		 1049 aa  1714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  87.32 
 
 		 1049 aa  1717    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  54.62 
 
 		 1048 aa  1079    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.6 
 
 		 1037 aa  1280    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.09 
 
 		 1066 aa  716    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.56 
 
 		 1071 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.4 
 
 		 1066 aa  715    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  55.72 
 
 		 1039 aa  1119    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  54.5 
 
 		 1039 aa  1098    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  69.11 
 
 		 1066 aa  1411    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  40.31 
 
 		 1036 aa  658    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  62.1 
 
 		 1034 aa  1266    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  76.98 
 
 		 1043 aa  1545    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  43.21 
 
 		 1041 aa  757    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.44 
 
 		 1092 aa  893    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  57.93 
 
 		 1047 aa  1160    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  85.89 
 
 		 1049 aa  1735    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  68.83 
 
 		 1058 aa  1402    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.54 
 
 		 1061 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  67.28 
 
 		 1037 aa  1306    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 		 1047 aa  2070    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  88.55 
 
 		 1048 aa  1803    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.96 
 
 		 1026 aa  726    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  75.09 
 
 		 1075 aa  1514    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  57.67 
 
 		 1043 aa  1124    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  43.54 
 
 		 1045 aa  797    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.35 
 
 		 1034 aa  763    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  54.46 
 
 		 1039 aa  1100    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.08 
 
 		 1039 aa  1138    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.08 
 
 		 1049 aa  1778    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  41.46 
 
 		 1040 aa  710    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  55.33 
 
 		 1039 aa  1113    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  55.14 
 
 		 1039 aa  1109    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  68.95 
 
 		 1043 aa  1389    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  69.2 
 
 		 1058 aa  1379    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  42.46 
 
 		 1030 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  38.39 
 
 		 1032 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.19 
 
 		 1052 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  38.23 
 
 		 1039 aa  582  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  35.86 
 
 		 1054 aa  578  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  35.52 
 
 		 1046 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.15 
 
 		 1064 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  36.95 
 
 		 1054 aa  558  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  33.71 
 
 		 1070 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.08 
 
 		 1065 aa  554  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  33.71 
 
 		 1070 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  34.6 
 
 		 1061 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.53 
 
 		 1043 aa  555  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  33.71 
 
 		 1070 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.33 
 
 		 1052 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.25 
 
 		 1029 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  33.62 
 
 		 1070 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.49 
 
 		 1070 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.39 
 
 		 1040 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  34.79 
 
 		 1062 aa  547  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.03 
 
 		 1062 aa  549  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.92 
 
 		 1049 aa  546  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  33.14 
 
 		 1051 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  35.21 
 
 		 1050 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  33.27 
 
 		 1077 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  33.27 
 
 		 1077 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  33.27 
 
 		 1077 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.46 
 
 		 1062 aa  537  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  33.08 
 
 		 1077 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  33.17 
 
 		 1077 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.14 
 
 		 1069 aa  539  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  33.17 
 
 		 1077 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  33.17 
 
 		 1077 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  32.44 
 
 		 1052 aa  535  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  32.67 
 
 		 1059 aa  535  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  32.95 
 
 		 1047 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  33.65 
 
 		 1077 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  33.37 
 
 		 1046 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  32.86 
 
 		 1083 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  37.39 
 
 		 1061 aa  535  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  31.77 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  31.77 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  32.95 
 
 		 1048 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  31.77 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  32.6 
 
 		 1054 aa  532  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  31.77 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  34.09 
 
 		 1033 aa  528  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  32.6 
 
 		 1053 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  32.99 
 
 		 1075 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  34.92 
 
 		 1074 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.73 
 
 		 1028 aa  526  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  32.47 
 
 		 1054 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  32.44 
 
 		 1048 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  34.29 
 
 		 1040 aa  526  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  31.68 
 
 		 1040 aa  523  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08540  heavy metal efflux pump CzcA family  34.94 
 
 		 1074 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.429916  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.83 
 
 		 1063 aa  522  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>