More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1297 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  37.97 
 
 		 1039 aa  647    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  48.53 
 
 		 1028 aa  887    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  65.83 
 
 		 1064 aa  1248    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.13 
 
 		 1092 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.7 
 
 		 1071 aa  655    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.4 
 
 		 1061 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  65.6 
 
 		 1064 aa  1235    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  39.18 
 
 		 1041 aa  673    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  51.35 
 
 		 1039 aa  952    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  64.26 
 
 		 1055 aa  1148    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  67.79 
 
 		 1054 aa  1350    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  65.44 
 
 		 1064 aa  1249    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  49.09 
 
 		 1046 aa  951    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  69.05 
 
 		 1061 aa  1315    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  39.92 
 
 		 1045 aa  666    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.7 
 
 		 1053 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.44 
 
 		 1054 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  55.56 
 
 		 1032 aa  1065    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  36.94 
 
 		 1054 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  100 
 
 		 1052 aa  2073    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  37.88 
 
 		 1023 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  37.87 
 
 		 1050 aa  622  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.72 
 
 		 1066 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.55 
 
 		 1034 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.62 
 
 		 1066 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  37.56 
 
 		 1034 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  38.3 
 
 		 1040 aa  599  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  35.98 
 
 		 1036 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.58 
 
 		 1049 aa  596  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  41.39 
 
 		 1033 aa  594  1e-168  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.69 
 
 		 1037 aa  595  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.38 
 
 		 1048 aa  589  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.49 
 
 		 1037 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  36.42 
 
 		 1039 aa  580  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.16 
 
 		 1039 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  37.2 
 
 		 1047 aa  579  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.96 
 
 		 1039 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  37.39 
 
 		 1043 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.31 
 
 		 1043 aa  579  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.15 
 
 		 1039 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.96 
 
 		 1039 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  37.21 
 
 		 1039 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.65 
 
 		 1039 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  36.44 
 
 		 1039 aa  570  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.84 
 
 		 1049 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.82 
 
 		 1026 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  36.91 
 
 		 1031 aa  566  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  37.27 
 
 		 1058 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  37.18 
 
 		 1066 aa  562  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.57 
 
 		 1049 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  37.23 
 
 		 1049 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  37.32 
 
 		 1058 aa  556  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  36.72 
 
 		 1075 aa  555  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  36.38 
 
 		 1043 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.91 
 
 		 1048 aa  548  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  35.07 
 
 		 1057 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  37.2 
 
 		 1047 aa  545  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  41.89 
 
 		 1034 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  40.74 
 
 		 1030 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1044 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1052 aa  528  1e-148  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.52 
 
 		 1020 aa  513  1e-144  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.62 
 
 		 1034 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  32.63 
 
 		 1046 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.28 
 
 		 1049 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  32.44 
 
 		 1032 aa  474  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.41 
 
 		 1047 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  32.15 
 
 		 1034 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  31.52 
 
 		 1065 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  32.07 
 
 		 1029 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  32.46 
 
 		 1069 aa  466  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  31.63 
 
 		 1031 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  32.44 
 
 		 1033 aa  465  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  33.77 
 
 		 1032 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.28 
 
 		 1034 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.43 
 
 		 1064 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  33.4 
 
 		 1032 aa  458  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  31 
 
 		 1049 aa  456  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.19 
 
 		 1022 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.18 
 
 		 1034 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  32.69 
 
 		 1034 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0204  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.82 
 
 		 1034 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.48458  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  31.95 
 
 		 1072 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  32.43 
 
 		 1066 aa  451  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  31.46 
 
 		 1082 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  31.05 
 
 		 1066 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  30.98 
 
 		 1052 aa  449  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  31.13 
 
 		 1074 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  31.81 
 
 		 1070 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  31.81 
 
 		 1070 aa  445  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  31.83 
 
 		 1059 aa  443  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  31.81 
 
 		 1070 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  31.81 
 
 		 1070 aa  445  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.93 
 
 		 1032 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  33.2 
 
 		 1035 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.63 
 
 		 1052 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  31.77 
 
 		 1070 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  31.81 
 
 		 1028 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  30.91 
 
 		 1064 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  30.73 
 
 		 1040 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>