More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3709 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  93.11 
 
 		 1061 aa  1776    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  72.08 
 
 		 1064 aa  1361    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  51.07 
 
 		 1028 aa  919    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  70.17 
 
 		 1055 aa  1243    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  35.67 
 
 		 1071 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  53.18 
 
 		 1032 aa  994    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  38.12 
 
 		 1050 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  67.79 
 
 		 1052 aa  1365    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  52.43 
 
 		 1039 aa  961    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  49.71 
 
 		 1046 aa  932    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  71.47 
 
 		 1064 aa  1341    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  71.53 
 
 		 1064 aa  1336    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1054 aa  2044    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  38.18 
 
 		 1054 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.87 
 
 		 1066 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.31 
 
 		 1061 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.58 
 
 		 1066 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  37.29 
 
 		 1041 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  38.15 
 
 		 1045 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  36.45 
 
 		 1039 aa  604  1.0000000000000001e-171  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  42.03 
 
 		 1033 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  37.41 
 
 		 1023 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  37.61 
 
 		 1034 aa  599  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.18 
 
 		 1054 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.87 
 
 		 1053 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.02 
 
 		 1037 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.96 
 
 		 1034 aa  582  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.29 
 
 		 1049 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.86 
 
 		 1037 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  36.16 
 
 		 1036 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.71 
 
 		 1092 aa  575  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.22 
 
 		 1048 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.45 
 
 		 1043 aa  571  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  37.62 
 
 		 1043 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.6 
 
 		 1049 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  37.35 
 
 		 1031 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  42.51 
 
 		 1034 aa  556  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  37.48 
 
 		 1049 aa  555  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.44 
 
 		 1039 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.73 
 
 		 1049 aa  556  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  37.29 
 
 		 1040 aa  555  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.17 
 
 		 1026 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.2 
 
 		 1039 aa  546  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  34.67 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  36.44 
 
 		 1047 aa  545  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  35.42 
 
 		 1057 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.48 
 
 		 1039 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.48 
 
 		 1039 aa  541  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  36.46 
 
 		 1075 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.08 
 
 		 1039 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 		 1066 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  34.41 
 
 		 1039 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 		 1058 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  37.63 
 
 		 1058 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  34.08 
 
 		 1039 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 		 1044 aa  534  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  37.05 
 
 		 1047 aa  532  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  35.15 
 
 		 1043 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.1 
 
 		 1048 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1052 aa  508  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.69 
 
 		 1034 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  33.27 
 
 		 1033 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.38 
 
 		 1020 aa  481  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  33.85 
 
 		 1029 aa  482  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  33.5 
 
 		 1046 aa  479  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.38 
 
 		 1047 aa  475  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  32.88 
 
 		 1032 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  30.97 
 
 		 1034 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.89 
 
 		 1049 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  33.13 
 
 		 1032 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  32.39 
 
 		 1065 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.72 
 
 		 1064 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1030 aa  468  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  32.07 
 
 		 1032 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  31.92 
 
 		 1043 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  33.46 
 
 		 1066 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  32.06 
 
 		 1034 aa  466  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  32.53 
 
 		 1031 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.39 
 
 		 1034 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.08 
 
 		 1052 aa  451  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  31.66 
 
 		 1069 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  32.09 
 
 		 1076 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  32.78 
 
 		 1045 aa  452  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  32.22 
 
 		 1070 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  32.85 
 
 		 1040 aa  452  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.4 
 
 		 1034 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  31.57 
 
 		 1053 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  32.41 
 
 		 1077 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  30.32 
 
 		 1049 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  32.13 
 
 		 1070 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  30.89 
 
 		 1059 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  32.5 
 
 		 1077 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  31.35 
 
 		 1050 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  32.5 
 
 		 1077 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  31.65 
 
 		 1051 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  32.24 
 
 		 1082 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  32.13 
 
 		 1070 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  32.13 
 
 		 1070 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  32.5 
 
 		 1077 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  32.25 
 
 		 1070 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>