More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4980 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1064 aa  2051    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.61 
 
 		 1028 aa  881    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  70.96 
 
 		 1061 aa  1309    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  53.6 
 
 		 1032 aa  998    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  98.21 
 
 		 1064 aa  2017    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  50.54 
 
 		 1039 aa  922    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  71.47 
 
 		 1054 aa  1375    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  68.83 
 
 		 1055 aa  1215    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  47.92 
 
 		 1046 aa  899    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  65.83 
 
 		 1052 aa  1287    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  91.52 
 
 		 1064 aa  1784    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.91 
 
 		 1061 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.14 
 
 		 1071 aa  629  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  37.7 
 
 		 1041 aa  621  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  39.9 
 
 		 1023 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1054 aa  612  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  37.48 
 
 		 1050 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.05 
 
 		 1066 aa  600  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.75 
 
 		 1066 aa  597  1e-169  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.11 
 
 		 1054 aa  593  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.75 
 
 		 1053 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  39.11 
 
 		 1045 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  36.44 
 
 		 1039 aa  585  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.25 
 
 		 1092 aa  585  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  37.18 
 
 		 1034 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 		 1040 aa  572  1e-161  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.95 
 
 		 1034 aa  561  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  36.27 
 
 		 1036 aa  558  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  37.87 
 
 		 1043 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  39.82 
 
 		 1033 aa  556  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1043 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.41 
 
 		 1048 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  35.93 
 
 		 1047 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.21 
 
 		 1049 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.27 
 
 		 1026 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  37.07 
 
 		 1031 aa  536  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.05 
 
 		 1037 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  35.28 
 
 		 1039 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.75 
 
 		 1037 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  36 
 
 		 1039 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.54 
 
 		 1049 aa  528  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1044 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  35.74 
 
 		 1043 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  35.41 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.51 
 
 		 1039 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.51 
 
 		 1039 aa  521  1e-146  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.13 
 
 		 1039 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  35.19 
 
 		 1039 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  36.62 
 
 		 1066 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.02 
 
 		 1039 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  37.05 
 
 		 1049 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.05 
 
 		 1049 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.09 
 
 		 1048 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  36.81 
 
 		 1058 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1052 aa  515  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1075 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 		 1058 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  41.82 
 
 		 1034 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  34.68 
 
 		 1057 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  36.25 
 
 		 1047 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  39.44 
 
 		 1030 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  31.37 
 
 		 1065 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.83 
 
 		 1020 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  31.93 
 
 		 1069 aa  465  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4441  CzcA family heavy metal efflux protein  30.07 
 
 		 1017 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.883147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  32.33 
 
 		 1029 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4246  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.07 
 
 		 1017 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  29.97 
 
 		 1017 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.3 
 
 		 1049 aa  459  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  30.07 
 
 		 1017 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  29.83 
 
 		 1017 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  29.83 
 
 		 1017 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  30.07 
 
 		 1017 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  32.91 
 
 		 1046 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  31.57 
 
 		 1049 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3766  CzcA family heavy metal efflux protein  31.22 
 
 		 1017 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  29.83 
 
 		 1017 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  31.74 
 
 		 1033 aa  446  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  31.37 
 
 		 1066 aa  446  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  32.03 
 
 		 1053 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  31.7 
 
 		 1054 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  31.74 
 
 		 1028 aa  445  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  31.06 
 
 		 1053 aa  443  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  31.06 
 
 		 1053 aa  443  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.78 
 
 		 1064 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  30.97 
 
 		 1053 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  31.51 
 
 		 1050 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  31.06 
 
 		 1053 aa  443  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  31.5 
 
 		 1051 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  32.87 
 
 		 1032 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0204  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.28 
 
 		 1034 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.48458  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  31.51 
 
 		 1069 aa  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  31.45 
 
 		 1040 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.78 
 
 		 1034 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  31.15 
 
 		 1052 aa  435  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.53 
 
 		 1022 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  31.42 
 
 		 1072 aa  435  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  32.29 
 
 		 1048 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  31.15 
 
 		 1044 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4315  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.29 
 
 		 1046 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>