More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2180 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1044 aa  2075    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  48.86 
 
 		 1050 aa  967    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  49.09 
 
 		 1057 aa  960    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  49.38 
 
 		 1054 aa  995    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  35.17 
 
 		 1052 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  35.49 
 
 		 1039 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  34.59 
 
 		 1032 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.64 
 
 		 1028 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 		 1054 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1064 aa  512  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  34.97 
 
 		 1064 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1046 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  31.2 
 
 		 1039 aa  504  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  34.92 
 
 		 1064 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  35.62 
 
 		 1061 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  33.11 
 
 		 1036 aa  491  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  29.97 
 
 		 1071 aa  485  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  32.37 
 
 		 1045 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  29.32 
 
 		 1066 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  29.23 
 
 		 1066 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1040 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  31.12 
 
 		 1023 aa  465  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.71 
 
 		 1048 aa  465  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.64 
 
 		 1061 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.41 
 
 		 1054 aa  462  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.56 
 
 		 1049 aa  458  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.73 
 
 		 1053 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  31.17 
 
 		 1034 aa  456  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  31.11 
 
 		 1041 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  32.3 
 
 		 1043 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.71 
 
 		 1039 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  31 
 
 		 1039 aa  452  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.53 
 
 		 1039 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.53 
 
 		 1039 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  30.28 
 
 		 1039 aa  451  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.38 
 
 		 1049 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  29.72 
 
 		 1039 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  30.04 
 
 		 1039 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.05 
 
 		 1039 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 		 1055 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.05 
 
 		 1048 aa  442  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.27 
 
 		 1092 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  31.18 
 
 		 1043 aa  432  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.82 
 
 		 1049 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1031 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1075 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.6 
 
 		 1026 aa  429  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  31.38 
 
 		 1049 aa  429  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  31.63 
 
 		 1043 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  31.56 
 
 		 1047 aa  423  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1058 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  31.57 
 
 		 1047 aa  419  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.76 
 
 		 1034 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1066 aa  415  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1058 aa  413  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1052 aa  412  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.67 
 
 		 1037 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.89 
 
 		 1037 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1030 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.06 
 
 		 1020 aa  352  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  26.93 
 
 		 1062 aa  352  3e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1033 aa  348  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  27.09 
 
 		 1054 aa  348  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  26.76 
 
 		 1070 aa  346  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  26.94 
 
 		 1070 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  26.94 
 
 		 1070 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  26.94 
 
 		 1070 aa  345  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  26.7 
 
 		 1070 aa  345  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  28.02 
 
 		 1051 aa  343  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  27.07 
 
 		 1064 aa  341  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  28.06 
 
 		 1048 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  27.09 
 
 		 1059 aa  340  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  27.18 
 
 		 1053 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  28.13 
 
 		 1048 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  27.18 
 
 		 1053 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  27.18 
 
 		 1053 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  26.59 
 
 		 1045 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  27.5 
 
 		 1032 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  25.71 
 
 		 1052 aa  337  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.93 
 
 		 1063 aa  337  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1466  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.19 
 
 		 1042 aa  337  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  26.93 
 
 		 1063 aa  337  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  27.59 
 
 		 1032 aa  336  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  26.52 
 
 		 1049 aa  335  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  27.52 
 
 		 1083 aa  336  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  27.78 
 
 		 1048 aa  336  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  27.09 
 
 		 1053 aa  335  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  27.69 
 
 		 1052 aa  334  5e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  26.88 
 
 		 1031 aa  334  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  26.65 
 
 		 1065 aa  333  8e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  26.94 
 
 		 1050 aa  333  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  27.89 
 
 		 1048 aa  332  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  27.18 
 
 		 1033 aa  332  3e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  25.57 
 
 		 1062 aa  332  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  26.29 
 
 		 1040 aa  332  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  27.09 
 
 		 1069 aa  330  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  26.46 
 
 		 1043 aa  330  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  26.5 
 
 		 1064 aa  330  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  25.7 
 
 		 1017 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.03 
 
 		 1458 aa  327  5e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>