More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3110 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  75.68 
 
 		 1034 aa  1259    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  42.66 
 
 		 1061 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  41.68 
 
 		 1052 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  42.33 
 
 		 1054 aa  673    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  42.62 
 
 		 1039 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  38.92 
 
 		 1046 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  42.7 
 
 		 1032 aa  707    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1033 aa  1993    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.9 
 
 		 1028 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  40.46 
 
 		 1064 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  39.82 
 
 		 1064 aa  611  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  40.31 
 
 		 1064 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  41.54 
 
 		 1055 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  34.49 
 
 		 1054 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  35.25 
 
 		 1045 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  33.82 
 
 		 1036 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.62 
 
 		 1092 aa  488  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.17 
 
 		 1054 aa  483  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  30.37 
 
 		 1071 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  33.3 
 
 		 1023 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  32.75 
 
 		 1034 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  30.7 
 
 		 1066 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.11 
 
 		 1053 aa  473  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  30.51 
 
 		 1066 aa  469  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.72 
 
 		 1034 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1050 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  32.2 
 
 		 1039 aa  464  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.28 
 
 		 1061 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.27 
 
 		 1048 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.63 
 
 		 1049 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1031 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  34.03 
 
 		 1043 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  34.38 
 
 		 1058 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1066 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  33.33 
 
 		 1043 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  31.44 
 
 		 1039 aa  446  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  32.29 
 
 		 1041 aa  446  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1058 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.42 
 
 		 1039 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.59 
 
 		 1039 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.08 
 
 		 1026 aa  439  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.02 
 
 		 1039 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.49 
 
 		 1049 aa  436  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.02 
 
 		 1039 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.59 
 
 		 1039 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.1 
 
 		 1049 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.98 
 
 		 1037 aa  432  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.05 
 
 		 1037 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1057 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  31 
 
 		 1039 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1040 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1052 aa  426  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1075 aa  426  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.73 
 
 		 1048 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  32.75 
 
 		 1049 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  30.57 
 
 		 1039 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  33.17 
 
 		 1047 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  31 
 
 		 1047 aa  411  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  30.39 
 
 		 1049 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  31.27 
 
 		 1043 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  31.28 
 
 		 1029 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  29.84 
 
 		 1052 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  30.92 
 
 		 1040 aa  397  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1044 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.06 
 
 		 1047 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  30.54 
 
 		 1077 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  35.81 
 
 		 1030 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  30.07 
 
 		 1077 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  30.13 
 
 		 1038 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  30.1 
 
 		 1077 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  30.1 
 
 		 1077 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  30.1 
 
 		 1077 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  29.99 
 
 		 1070 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  29.29 
 
 		 1062 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  30.01 
 
 		 1077 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.52 
 
 		 1034 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  30.05 
 
 		 1070 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  30.1 
 
 		 1077 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  30.1 
 
 		 1077 aa  386  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  29.87 
 
 		 1043 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  30.56 
 
 		 1064 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  29.9 
 
 		 1070 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  29.36 
 
 		 1043 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  29.91 
 
 		 1070 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  29.9 
 
 		 1070 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  31.2 
 
 		 1032 aa  379  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  28.29 
 
 		 1065 aa  380  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  29.32 
 
 		 1083 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  28.34 
 
 		 1032 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  30.1 
 
 		 1062 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  29.61 
 
 		 1082 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.08 
 
 		 1034 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  29.5 
 
 		 1064 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  30.01 
 
 		 1031 aa  371  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  27.63 
 
 		 1034 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  28.26 
 
 		 1047 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.05 
 
 		 1052 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  29.39 
 
 		 1069 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  29.71 
 
 		 1066 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  29.68 
 
 		 1033 aa  365  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>