More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3340 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  47.85 
 
 		 1028 aa  848    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  70.27 
 
 		 1054 aa  1338    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  69.67 
 
 		 1064 aa  1287    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  52.37 
 
 		 1032 aa  965    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1055 aa  2030    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  64.26 
 
 		 1052 aa  1269    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  49.86 
 
 		 1039 aa  895    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  69.89 
 
 		 1061 aa  1280    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  69.33 
 
 		 1064 aa  1292    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  47.36 
 
 		 1046 aa  890    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  37.33 
 
 		 1050 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  70.64 
 
 		 1064 aa  1306    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 		 1054 aa  615  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  39.42 
 
 		 1045 aa  609  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.87 
 
 		 1053 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  37.24 
 
 		 1041 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.89 
 
 		 1054 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.52 
 
 		 1092 aa  580  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  32.83 
 
 		 1071 aa  578  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  34.57 
 
 		 1039 aa  575  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.85 
 
 		 1061 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  36.89 
 
 		 1034 aa  576  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  41.48 
 
 		 1033 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  36.43 
 
 		 1023 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  33.79 
 
 		 1066 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  33.59 
 
 		 1066 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  38.53 
 
 		 1043 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  37.35 
 
 		 1043 aa  550  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.55 
 
 		 1034 aa  552  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.73 
 
 		 1049 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.63 
 
 		 1048 aa  549  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.76 
 
 		 1026 aa  542  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.6 
 
 		 1037 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  36.68 
 
 		 1031 aa  539  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.36 
 
 		 1037 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.82 
 
 		 1049 aa  535  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  37.03 
 
 		 1049 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  36.37 
 
 		 1040 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.01 
 
 		 1049 aa  526  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  43.41 
 
 		 1034 aa  525  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.44 
 
 		 1039 aa  522  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  37.18 
 
 		 1066 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  34.54 
 
 		 1039 aa  521  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 		 1057 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  36.51 
 
 		 1058 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.79 
 
 		 1039 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.79 
 
 		 1039 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1058 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  34.02 
 
 		 1039 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  35.9 
 
 		 1075 aa  515  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.03 
 
 		 1039 aa  516  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  35.4 
 
 		 1047 aa  515  1e-144  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.12 
 
 		 1039 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  33.66 
 
 		 1039 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 		 1044 aa  504  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.39 
 
 		 1020 aa  501  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  36.4 
 
 		 1047 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  35.22 
 
 		 1043 aa  499  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  33.64 
 
 		 1036 aa  492  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.59 
 
 		 1048 aa  493  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1052 aa  488  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  39.65 
 
 		 1030 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  31.37 
 
 		 1059 aa  475  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  32.98 
 
 		 1064 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  31.88 
 
 		 1072 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  31.4 
 
 		 1040 aa  464  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.43 
 
 		 1049 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  30.92 
 
 		 1049 aa  462  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  32.76 
 
 		 1070 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  33.11 
 
 		 1046 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  32.51 
 
 		 1070 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  32.48 
 
 		 1070 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  31.4 
 
 		 1069 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  32.48 
 
 		 1070 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  32.48 
 
 		 1070 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.39 
 
 		 1052 aa  458  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.42 
 
 		 1063 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  32.1 
 
 		 1050 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  31.49 
 
 		 1065 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  31.7 
 
 		 1062 aa  456  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  31.91 
 
 		 1029 aa  455  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  31.78 
 
 		 1043 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  33.11 
 
 		 1077 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  33.02 
 
 		 1077 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  30.41 
 
 		 1052 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  33.11 
 
 		 1077 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  33.11 
 
 		 1077 aa  452  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  31.46 
 
 		 1031 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  31.32 
 
 		 1063 aa  452  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  31.29 
 
 		 1037 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  32.92 
 
 		 1077 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  31.49 
 
 		 1033 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  30.75 
 
 		 1053 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  30.45 
 
 		 1066 aa  448  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  32.92 
 
 		 1077 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.02 
 
 		 1047 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  32.92 
 
 		 1077 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  31.65 
 
 		 1066 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  30.75 
 
 		 1053 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  32.48 
 
 		 1077 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>