More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3466 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1057 aa  2108    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  49.76 
 
 		 1050 aa  982    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  48 
 
 		 1054 aa  953    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  49.09 
 
 		 1044 aa  971    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  35.07 
 
 		 1052 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  35.66 
 
 		 1039 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1032 aa  542  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  35.42 
 
 		 1054 aa  538  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.53 
 
 		 1028 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  35.86 
 
 		 1061 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  32.57 
 
 		 1039 aa  505  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.01 
 
 		 1061 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  33.68 
 
 		 1046 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 		 1064 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  33.53 
 
 		 1023 aa  496  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  32.21 
 
 		 1034 aa  496  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.83 
 
 		 1053 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  34.73 
 
 		 1064 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 		 1064 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  32.76 
 
 		 1043 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.99 
 
 		 1054 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.89 
 
 		 1048 aa  479  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.72 
 
 		 1092 aa  479  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.97 
 
 		 1039 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.97 
 
 		 1039 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.94 
 
 		 1037 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.11 
 
 		 1048 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.76 
 
 		 1049 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  30.74 
 
 		 1066 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  30.66 
 
 		 1036 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  32.15 
 
 		 1041 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.21 
 
 		 1039 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.45 
 
 		 1039 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  30.83 
 
 		 1039 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  31.8 
 
 		 1047 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  29.12 
 
 		 1071 aa  465  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  30.73 
 
 		 1066 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  32.11 
 
 		 1045 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  31.99 
 
 		 1043 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1031 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  31.13 
 
 		 1039 aa  466  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.6 
 
 		 1049 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  30.71 
 
 		 1039 aa  459  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 		 1055 aa  459  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.29 
 
 		 1039 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.66 
 
 		 1037 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  32.36 
 
 		 1043 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1040 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.83 
 
 		 1034 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.07 
 
 		 1049 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  32.73 
 
 		 1049 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1075 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  32.56 
 
 		 1047 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1052 aa  434  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1058 aa  436  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1066 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1058 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.44 
 
 		 1026 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1033 aa  386  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1030 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.54 
 
 		 1049 aa  373  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1466  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.06 
 
 		 1042 aa  347  8e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  27.1 
 
 		 1065 aa  346  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  28.03 
 
 		 1034 aa  346  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  28.34 
 
 		 1054 aa  345  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  28.58 
 
 		 1045 aa  344  4e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  28.05 
 
 		 1051 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.11 
 
 		 1020 aa  342  2e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  27.97 
 
 		 1033 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  27.76 
 
 		 1050 aa  341  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  27.86 
 
 		 1062 aa  341  5e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  26.99 
 
 		 1029 aa  340  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  26.75 
 
 		 1031 aa  340  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  28.02 
 
 		 1082 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  28.54 
 
 		 1048 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.35 
 
 		 1062 aa  338  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  28.45 
 
 		 1076 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  27.23 
 
 		 1066 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  25.31 
 
 		 1032 aa  337  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  27.61 
 
 		 1049 aa  336  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  28.09 
 
 		 1043 aa  335  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  27.43 
 
 		 1069 aa  335  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  26.34 
 
 		 1064 aa  333  7.000000000000001e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  27.52 
 
 		 1062 aa  333  7.000000000000001e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0387  CzcA family heavy metal efflux protein  27.98 
 
 		 1051 aa  333  8e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  27.91 
 
 		 1048 aa  333  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  27.99 
 
 		 1059 aa  333  1e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  27.15 
 
 		 1462 aa  333  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  27.5 
 
 		 1032 aa  333  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  27.34 
 
 		 1023 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  27.84 
 
 		 1048 aa  332  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  26.78 
 
 		 1052 aa  331  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  27.91 
 
 		 1048 aa  331  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  27.43 
 
 		 1053 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  27.43 
 
 		 1053 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  27.43 
 
 		 1053 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  26.56 
 
 		 1040 aa  330  9e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1011 aa  330  9e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  26.72 
 
 		 1028 aa  330  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  28.32 
 
 		 1046 aa  330  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>