More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2231 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0498  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.08 
 
 		 1070 aa  636    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249321  normal  0.409358 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  35.64 
 
 		 1037 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  35.64 
 
 		 1037 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2900  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.9 
 
 		 1046 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  35.72 
 
 		 1050 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2818  multidrug efflux RND transporter MexD  37.21 
 
 		 1042 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.9 
 
 		 1070 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.73 
 
 		 1054 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2231  HAE1 efflux family protein  100 
 
 		 1037 aa  2103    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.601813  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  36.54 
 
 		 1049 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  36 
 
 		 1052 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  39.41 
 
 		 1037 aa  730    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  36.01 
 
 		 1040 aa  695    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  38.17 
 
 		 1051 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  38.54 
 
 		 1074 aa  688    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.66 
 
 		 1044 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1164  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.11 
 
 		 1040 aa  698    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0522045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4338  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.82 
 
 		 1050 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.107796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.85 
 
 		 1044 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0826  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.86 
 
 		 1045 aa  720    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1050 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1050 aa  645    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  35.3 
 
 		 1052 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  37.05 
 
 		 1050 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1775  acriflavine resistance protein B  36.08 
 
 		 1051 aa  655    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00032562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.05 
 
 		 1063 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.37 
 
 		 1044 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.94 
 
 		 1040 aa  705    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.24 
 
 		 1057 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.47 
 
 		 1050 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0389  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  35.91 
 
 		 1040 aa  696    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.57 
 
 		 1057 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3796  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.53 
 
 		 1042 aa  671    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.32 
 
 		 1059 aa  656    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.73 
 
 		 1054 aa  653    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.32 
 
 		 1063 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0568  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.19 
 
 		 1054 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.37 
 
 		 1032 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  37.15 
 
 		 1060 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  36.38 
 
 		 1042 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.4 
 
 		 1038 aa  1031    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0807  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.59 
 
 		 1070 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1203  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.38 
 
 		 1055 aa  731    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0458875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.04 
 
 		 1044 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186908  normal  0.57083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4131  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.49 
 
 		 1057 aa  833    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  36.79 
 
 		 1034 aa  710    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.43 
 
 		 1057 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.36 
 
 		 1038 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0850  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.46 
 
 		 1074 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1727  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  74.2 
 
 		 1059 aa  1581    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0256707  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0564  AcrB protein  35.46 
 
 		 1054 aa  638    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00145035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  65.15 
 
 		 1068 aa  1440    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4862  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  58.62 
 
 		 1055 aa  1290    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0141  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.97 
 
 		 1047 aa  666    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2567  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.87 
 
 		 1047 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.461697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10063  putative AcrB/AcrD family RND transport protein  45.2 
 
 		 1049 aa  860    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.133163  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1190  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.89 
 
 		 1057 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0696515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0376  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.46 
 
 		 1049 aa  744    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433431  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.73 
 
 		 1047 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0373  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  76.74 
 
 		 1059 aa  1713    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.48 
 
 		 1037 aa  713    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  37.34 
 
 		 1076 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0868  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.69 
 
 		 1080 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0225555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.74 
 
 		 1042 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.68 
 
 		 1066 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.5 
 
 		 1057 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315153  normal  0.171354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2433  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.88 
 
 		 1051 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3227  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.07 
 
 		 1050 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37 
 
 		 1063 aa  675    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0388  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.96 
 
 		 1052 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0907  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.45 
 
 		 1048 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.87 
 
 		 1059 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.57 
 
 		 1043 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.88 
 
 		 1055 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3420  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.04 
 
 		 1042 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0306  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  38.45 
 
 		 1074 aa  687    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0538  AcrB/AcrD family multidrug resistance protein  51.93 
 
 		 1048 aa  1056    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199673  normal  0.872862 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1591  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  36.01 
 
 		 1040 aa  699    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2860  acridine efflux pump  62.94 
 
 		 1055 aa  1346    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00427277  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.28 
 
 		 1044 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.28 
 
 		 1044 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.45 
 
 		 1058 aa  653    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.07 
 
 		 1038 aa  700    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2643  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.11 
 
 		 1058 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  37.08 
 
 		 1046 aa  660    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4361  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.29 
 
 		 1065 aa  651    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0447912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1084  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.5 
 
 		 1032 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00807146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  37.61 
 
 		 1043 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0526  RND multidrug efflux transporter MexB  37.18 
 
 		 1046 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4300  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.46 
 
 		 1054 aa  789    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.13 
 
 		 1063 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.58 
 
 		 1055 aa  664    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.02 
 
 		 1052 aa  666    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3716  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.76 
 
 		 1047 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.57 
 
 		 1044 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0118  transmembrane efflux protein  35.21 
 
 		 1048 aa  672    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0411  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.14 
 
 		 1073 aa  653    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0776  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  35.39 
 
 		 1055 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1563  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.39 
 
 		 1061 aa  808    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0198604  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5239  RND multidrug efflux transporter MexD  37.33 
 
 		 1043 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>