More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1084 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  39.63 
 
 
1049 aa  723    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  39.09 
 
 
1037 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  40.62 
 
 
1034 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.53 
 
 
1034 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.09 
 
 
1037 aa  714    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.63 
 
 
1049 aa  723    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2696  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.15 
 
 
1052 aa  714    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.91 
 
 
1050 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  40.02 
 
 
1059 aa  731    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96069  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.59 
 
 
1054 aa  816    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  42.84 
 
 
1055 aa  809    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.91 
 
 
1052 aa  822    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  46.26 
 
 
1037 aa  931    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  38.71 
 
 
1040 aa  778    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  43.91 
 
 
1051 aa  853    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  47.1 
 
 
1074 aa  907    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3492  RND multidrug efflux transporter MexF  40.43 
 
 
1047 aa  732    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  40.95 
 
 
1063 aa  749    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.34 
 
 
1044 aa  710    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  39.03 
 
 
1061 aa  731    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  38.93 
 
 
1050 aa  771    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  39.29 
 
 
1050 aa  744    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  38.64 
 
 
1052 aa  763    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  39.19 
 
 
1050 aa  740    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2865  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.08 
 
 
1048 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536014  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.08 
 
 
1063 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.3 
 
 
1040 aa  824    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.9 
 
 
1057 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.29 
 
 
1051 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.13 
 
 
1050 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.97 
 
 
1057 aa  846    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  39.03 
 
 
1061 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.22 
 
 
1059 aa  869    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.16 
 
 
1071 aa  760    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0746968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.15 
 
 
1054 aa  708    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.89 
 
 
1063 aa  759    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.45 
 
 
1043 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  39.77 
 
 
1060 aa  731    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  47.08 
 
 
1042 aa  904    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  39.03 
 
 
1066 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.86 
 
 
1044 aa  808    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186908  normal  0.57083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0401  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.71 
 
 
1055 aa  900    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.913827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  38.34 
 
 
1034 aa  757    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.98 
 
 
1057 aa  825    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.25 
 
 
1038 aa  796    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0850  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.86 
 
 
1074 aa  727    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.31 
 
 
1052 aa  721    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  39.15 
 
 
1061 aa  734    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2567  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.13 
 
 
1047 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.461697 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1190  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.52 
 
 
1057 aa  786    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0696515  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3585  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.19 
 
 
1050 aa  805    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.63 
 
 
1047 aa  836    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.02 
 
 
1037 aa  815    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  41.38 
 
 
1076 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3080  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.56 
 
 
1078 aa  721    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.29 
 
 
1062 aa  766    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.89 
 
 
1066 aa  761    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.96 
 
 
1057 aa  780    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0993  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.97 
 
 
1048 aa  775    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.98 
 
 
1063 aa  803    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.62 
 
 
1050 aa  741    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  39.17 
 
 
1048 aa  708    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.02 
 
 
1059 aa  779    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.82 
 
 
1043 aa  805    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.71 
 
 
1055 aa  755    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3420  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.27 
 
 
1042 aa  810    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.84 
 
 
1061 aa  732    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0738  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.45 
 
 
1055 aa  760    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4125  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.92 
 
 
1058 aa  744    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0790876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0538  AcrB/AcrD family multidrug resistance protein  38.62 
 
 
1048 aa  723    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199673  normal  0.872862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0941  acriflavin resistance protein D  41.78 
 
 
1056 aa  758    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389771  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1074  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.15 
 
 
1049 aa  730    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1940  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.27 
 
 
1055 aa  770    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0454025  hitchhiker  0.00180133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.48 
 
 
1044 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1146  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.15 
 
 
1049 aa  733    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204778  normal  0.908583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.27 
 
 
1055 aa  770    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.449144  normal  0.194235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.48 
 
 
1044 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.24 
 
 
1058 aa  792    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3986  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.84 
 
 
1053 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.943465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.65 
 
 
1071 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  41.05 
 
 
1046 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18780  putative RND efflux transporter  41.23 
 
 
1053 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0445074  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  41.19 
 
 
1062 aa  750    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  40.45 
 
 
1043 aa  709    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4745  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.63 
 
 
1057 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242644  normal  0.0121523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.84 
 
 
1061 aa  732    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1075  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.04 
 
 
1065 aa  732    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.82 
 
 
1063 aa  767    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.31 
 
 
1055 aa  776    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.83 
 
 
1052 aa  892    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1078  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.15 
 
 
1049 aa  731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1993  acriflavin resistance protein  42.27 
 
 
1055 aa  768    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194422  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.38 
 
 
1044 aa  718    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0118  transmembrane efflux protein  38.81 
 
 
1048 aa  763    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.44 
 
 
1054 aa  719    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0411  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.09 
 
 
1073 aa  791    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2139  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.32 
 
 
1038 aa  929    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3455  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.85 
 
 
1036 aa  782    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0141  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.77 
 
 
1047 aa  819    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2900  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.6 
 
 
1046 aa  830    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>