More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0376 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  45.62 
 
 		 1049 aa  884    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  44.15 
 
 		 1037 aa  881    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  45.4 
 
 		 1034 aa  857    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03362  multidrug transporter, RpoS-dependent  45.11 
 
 		 1037 aa  856    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0199  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.11 
 
 		 1037 aa  856    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.3 
 
 		 1034 aa  856    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.15 
 
 		 1037 aa  881    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  45.62 
 
 		 1049 aa  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.95 
 
 		 1050 aa  856    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  48.42 
 
 		 1059 aa  913    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.56 
 
 		 1054 aa  879    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  48.21 
 
 		 1055 aa  902    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  45.09 
 
 		 1049 aa  885    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  45.05 
 
 		 1053 aa  858    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1113  transmembrane multidrug-efflux system lipoprotein transmembrane  47.8 
 
 		 1069 aa  853    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.674026  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  52.28 
 
 		 1052 aa  1113    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  47.5 
 
 		 1037 aa  974    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  53.7 
 
 		 1040 aa  1120    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  94.98 
 
 		 1051 aa  1979    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  46.21 
 
 		 1074 aa  898    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.53 
 
 		 1044 aa  920    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  47.68 
 
 		 1063 aa  907    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.55 
 
 		 1044 aa  872    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0316  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  46.99 
 
 		 1066 aa  889    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.611401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  47.44 
 
 		 1061 aa  902    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  43.53 
 
 		 1050 aa  864    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  43.28 
 
 		 1052 aa  862    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.71 
 
 		 1047 aa  852    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.85 
 
 		 1063 aa  914    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.63 
 
 		 1044 aa  875    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1576  RND superfmily multidrug/dye/detergent efflux pump AcrB  42.33 
 
 		 1075 aa  850    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00327215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  56.06 
 
 		 1040 aa  1150    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.92 
 
 		 1057 aa  1030    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.01 
 
 		 1051 aa  887    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.11 
 
 		 1050 aa  888    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.51 
 
 		 1063 aa  867    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.637408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.24 
 
 		 1057 aa  872    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  47.09 
 
 		 1066 aa  893    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  47.44 
 
 		 1061 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.33 
 
 		 1059 aa  899    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.68 
 
 		 1054 aa  872    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.26 
 
 		 1063 aa  920    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.94 
 
 		 1043 aa  865    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.52 
 
 		 1032 aa  874    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  44.41 
 
 		 1060 aa  857    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  47.61 
 
 		 1042 aa  956    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  47.09 
 
 		 1063 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5939  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  46.9 
 
 		 1066 aa  885    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794955  normal  0.377291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  47.34 
 
 		 1066 aa  900    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  52.81 
 
 		 1034 aa  1116    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.72 
 
 		 1057 aa  1041    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  54.03 
 
 		 1038 aa  1080    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0850  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.19 
 
 		 1074 aa  962    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.31 
 
 		 1052 aa  885    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2051  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.56 
 
 		 1050 aa  849    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.625984  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  47.73 
 
 		 1061 aa  906    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  47.09 
 
 		 1066 aa  892    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.77 
 
 		 1048 aa  850    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3303  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.6 
 
 		 1078 aa  870    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.110746  normal  0.948069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  63.75 
 
 		 1047 aa  1349    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.38 
 
 		 1037 aa  1117    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  46.95 
 
 		 1069 aa  894    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2892  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  47.11 
 
 		 1088 aa  867    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0850  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  47.67 
 
 		 1061 aa  864    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033039  decreased coverage  0.00102824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  51.33 
 
 		 1076 aa  1046    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3080  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.55 
 
 		 1078 aa  853    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3602  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.76 
 
 		 1046 aa  878    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.79 
 
 		 1062 aa  901    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.67 
 
 		 1066 aa  1055    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.84 
 
 		 1057 aa  864    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  51.5 
 
 		 1063 aa  1042    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.32 
 
 		 1050 aa  889    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  45.33 
 
 		 1048 aa  882    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4866  acriflavin resistance protein F  47.53 
 
 		 1081 aa  856    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0385197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.98 
 
 		 1055 aa  852    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.45 
 
 		 1054 aa  853    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.05 
 
 		 1066 aa  883    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.25 
 
 		 1061 aa  900    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.19 
 
 		 1063 aa  869    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347364  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4125  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.19 
 
 		 1058 aa  856    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0790876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.46 
 
 		 1044 aa  918    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.46 
 
 		 1044 aa  918    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  54.24 
 
 		 1058 aa  1112    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.93 
 
 		 1051 aa  885    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.9 
 
 		 1066 aa  884    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.25 
 
 		 1071 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  47.72 
 
 		 1046 aa  923    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  48.06 
 
 		 1062 aa  915    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  45.05 
 
 		 1043 aa  869    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.05 
 
 		 1066 aa  883    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.25 
 
 		 1061 aa  900    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6205  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.19 
 
 		 1063 aa  869    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956257  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1075  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.62 
 
 		 1065 aa  919    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.58 
 
 		 1063 aa  944    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.23 
 
 		 1055 aa  856    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.19 
 
 		 1052 aa  958    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.27 
 
 		 1044 aa  914    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0118  transmembrane efflux protein  52 
 
 		 1048 aa  1097    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.92 
 
 		 1054 aa  863    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0411  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  47.67 
 
 		 1073 aa  967    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>