More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3335 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3335  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 474 aa  941    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  52.67 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  43.07 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  37.21 
 
 		 445 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  38.44 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  38.3 
 
 		 447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1779  peptidase M48 Ste24p  36.48 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00812626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.99 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  34.54 
 
 		 436 aa  113  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  33.75 
 
 		 529 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.2 
 
 		 424 aa  103  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  27.72 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  26.18 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  31.6 
 
 		 494 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  28.7 
 
 		 280 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 		 266 aa  86.7  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  33.17 
 
 		 479 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  31.48 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  25.47 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  31.48 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  24.49 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  27.98 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  30.53 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  28.31 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.19 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  25.76 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  30.86 
 
 		 490 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  31.16 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  34.24 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  34.36 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  31.18 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  32.69 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  32.69 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  28 
 
 		 278 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  27.31 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  30.35 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.57 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  33.65 
 
 		 493 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  30.52 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2400  peptidase M48, Ste24p  27.75 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0992443  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  27.88 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  27.67 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  27.05 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  26.97 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  29.27 
 
 		 485 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  27.98 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  29.44 
 
 		 289 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  26.9 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  29.35 
 
 		 294 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  29.67 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 604 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  27.47 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  27.4 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  27.36 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  26.72 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  26.26 
 
 		 605 aa  70.1  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  25.47 
 
 		 264 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  29.63 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  29.1 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  32.72 
 
 		 593 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  35.77 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  29.75 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0183  peptidase M48 Ste24p  26.13 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.457604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  32.55 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2378  peptidase M48 Ste24p  24.66 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  25.82 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0556  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  29.13 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0130  peptidase M48, Ste24p  27.65 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  24.74 
 
 		 494 aa  67  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 588 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 588 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  29.82 
 
 		 265 aa  67  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  32.91 
 
 		 589 aa  67  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 564 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  29.8 
 
 		 489 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  29.78 
 
 		 268 aa  67  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  26.56 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>