More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1681 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 400 aa  804    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  62.76 
 
 		 398 aa  458  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  64.96 
 
 		 378 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  55.38 
 
 		 390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  59.01 
 
 		 391 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  51.57 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  50.79 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52 
 
 		 406 aa  330  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  50.54 
 
 		 359 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.21 
 
 		 373 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.99 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.24 
 
 		 372 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.97 
 
 		 373 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  37.8 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  37.8 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  37.8 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  38.16 
 
 		 378 aa  239  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  36.8 
 
 		 377 aa  237  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  37.83 
 
 		 390 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.92 
 
 		 387 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.66 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.66 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  42.09 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.66 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.66 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  35.79 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  36.68 
 
 		 378 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  38 
 
 		 376 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  37.18 
 
 		 392 aa  232  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 		 423 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  36.87 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.8 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  42.58 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  42.58 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.2 
 
 		 422 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  36.63 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  42.3 
 
 		 367 aa  229  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  38.32 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  39.46 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  36.75 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  37.14 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  37.57 
 
 		 378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  38.19 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.44 
 
 		 394 aa  225  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  36.84 
 
 		 380 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  36.88 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  37.14 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.86 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.21 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  40.54 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  35.71 
 
 		 392 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  42.05 
 
 		 400 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  39.25 
 
 		 372 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  38.13 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  39.15 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1812  methionine gamma-lyase  37.91 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  36.9 
 
 		 380 aa  222  7e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0881  cystathionine gamma-synthase  36.36 
 
 		 386 aa  222  9e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.48 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  36.62 
 
 		 393 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  37.7 
 
 		 389 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  36.17 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  37.29 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1495  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.37 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0842973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  36.1 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.7 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  39.3 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  36.91 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2545  methionine gamma-lyase  37.21 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.229973  normal  0.0274745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  39.28 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  37.59 
 
 		 400 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  37.57 
 
 		 386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  37.59 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  38.94 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1383  Cystathionine gamma-synthase  37.5 
 
 		 376 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000104291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  39.67 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  34.56 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  37.3 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  38.94 
 
 		 386 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  39.66 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  37.23 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  37.63 
 
 		 405 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  39.04 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  38.59 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  35.09 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.1 
 
 		 386 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  37.61 
 
 		 373 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.46 
 
 		 380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0165  cystathionine beta-lyase  34.83 
 
 		 384 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2477  methionine gamma-lyase  36.69 
 
 		 397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.634477  hitchhiker  0.00203865 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33390  cystathione gamma synthase  35.16 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0131523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  42.94 
 
 		 379 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  35.81 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>