More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1362 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 406 aa  778    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  54.96 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  54.1 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  59.53 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  58.2 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  56.14 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  57.22 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  54.18 
 
 		 359 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  51.86 
 
 		 400 aa  339  4e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  54.45 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  50.28 
 
 		 373 aa  299  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.79 
 
 		 368 aa  297  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  47.33 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  46.26 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.54 
 
 		 373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  47.27 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  46.95 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  44.71 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  43.44 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  43.19 
 
 		 381 aa  276  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  44.74 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  45.31 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  46.83 
 
 		 387 aa  273  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  44.96 
 
 		 378 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  41.02 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 		 390 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  45.19 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  44.36 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.36 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 		 400 aa  263  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  43.82 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  41.88 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  41.11 
 
 		 380 aa  258  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.93 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  43.04 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  39.74 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  43.2 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  38.22 
 
 		 379 aa  256  7e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.22 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.16 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.96 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  40.45 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  46.98 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  46.84 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  44.41 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.96 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.05 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.37 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.9 
 
 		 392 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  46.3 
 
 		 383 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  39.28 
 
 		 401 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  40.31 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  38.85 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  41.67 
 
 		 394 aa  251  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.69 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  41.32 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  42.42 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.9 
 
 		 389 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  42.37 
 
 		 390 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.48 
 
 		 387 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.43 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  39.01 
 
 		 387 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.68 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  44.83 
 
 		 381 aa  249  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  39.89 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  39.89 
 
 		 393 aa  249  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.86 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  44.8 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  44.77 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.34 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  42.37 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  43.29 
 
 		 426 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  42.46 
 
 		 390 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  43.54 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  42.11 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  40.43 
 
 		 386 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  41.57 
 
 		 389 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.29 
 
 		 422 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  44.56 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  41.76 
 
 		 387 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.42 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  39.63 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  40.16 
 
 		 386 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  44.71 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  38.12 
 
 		 379 aa  243  6e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  44.79 
 
 		 384 aa  242  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  41.8 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  39.32 
 
 		 386 aa  242  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  39.63 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  42.78 
 
 		 426 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  37.29 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>