More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3292 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  100 
 
 		 359 aa  707    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  54.96 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  54.18 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.74 
 
 		 391 aa  349  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  53.91 
 
 		 378 aa  348  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.79 
 
 		 396 aa  342  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  52.8 
 
 		 390 aa  338  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  49.87 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  50.54 
 
 		 400 aa  330  2e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.49 
 
 		 373 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.31 
 
 		 368 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.59 
 
 		 372 aa  293  4e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.95 
 
 		 373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  40.99 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  46.33 
 
 		 383 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  44.15 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  40.73 
 
 		 390 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  40.73 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  43.86 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.6 
 
 		 397 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  42.13 
 
 		 379 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  39.55 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  43.09 
 
 		 383 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  39.58 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  38.62 
 
 		 381 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  41.88 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  44.24 
 
 		 381 aa  239  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  46.15 
 
 		 385 aa  238  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  44.26 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  42.63 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  39.11 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  44.15 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  41.09 
 
 		 390 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  42.06 
 
 		 390 aa  235  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  40.06 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.77 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.01 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  41.53 
 
 		 387 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.08 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  40.39 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  41 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  43.22 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.42 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  41.02 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  38.52 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  41.02 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  41.02 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  41.53 
 
 		 390 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  38.57 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  42.9 
 
 		 380 aa  229  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  38.57 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  39.2 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.06 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.66 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 393 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  38.89 
 
 		 386 aa  226  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  41.18 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  38.83 
 
 		 380 aa  226  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  36.79 
 
 		 400 aa  225  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  37.79 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  41.22 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  41.39 
 
 		 390 aa  223  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  43.34 
 
 		 384 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.19 
 
 		 398 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0390  cystathionine gamma-synthase  36.99 
 
 		 364 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  38.2 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  40.88 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40.06 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.7 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  42.63 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.34 
 
 		 422 aa  222  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  37.14 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1495  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.02 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0842973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  37.4 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  36.6 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.76 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.76 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  44.71 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.5 
 
 		 387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.34 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  39.63 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.23 
 
 		 389 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  38.4 
 
 		 376 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  38.98 
 
 		 378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.5 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  37.5 
 
 		 383 aa  219  5e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  37.14 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.5 
 
 		 387 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  36.97 
 
 		 380 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  37.47 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  38.28 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  38.14 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.73 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  37.6 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.68 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  38.2 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  40.85 
 
 		 386 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>