More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2311 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 
391 aa  747    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  66.07 
 
 
398 aa  468  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  67.62 
 
 
378 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  58.12 
 
 
394 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.31 
 
 
396 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  60.87 
 
 
390 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  59.01 
 
 
400 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  59.33 
 
 
406 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  52.74 
 
 
359 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.74 
 
 
372 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  45.85 
 
 
379 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 
387 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  44.47 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  43.62 
 
 
393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  43.56 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.83 
 
 
368 aa  272  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  43.26 
 
 
392 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  43.26 
 
 
392 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  43.26 
 
 
392 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  44.81 
 
 
383 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.3 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.3 
 
 
373 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  43.81 
 
 
379 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  46.91 
 
 
380 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  46.92 
 
 
380 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  44.7 
 
 
387 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  43.93 
 
 
381 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  44.56 
 
 
384 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  43.81 
 
 
389 aa  261  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  40.52 
 
 
377 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 
381 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.48 
 
 
394 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.76 
 
 
402 aa  257  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  46.94 
 
 
434 aa  257  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  44.7 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  40.67 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  42.11 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  42.28 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.34 
 
 
378 aa  253  5.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  39.85 
 
 
378 aa  251  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  42.03 
 
 
390 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  44.22 
 
 
392 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.56 
 
 
387 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  41.54 
 
 
389 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  39.64 
 
 
386 aa  251  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.31 
 
 
387 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  42.03 
 
 
390 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  40.61 
 
 
401 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.82 
 
 
387 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  40.15 
 
 
376 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.31 
 
 
387 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.56 
 
 
387 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.87 
 
 
378 aa  249  8e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.86 
 
 
422 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  38.94 
 
 
380 aa  247  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.39 
 
 
386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  41.21 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  38.65 
 
 
381 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  39.54 
 
 
393 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  39.54 
 
 
393 aa  246  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  38 
 
 
400 aa  246  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.34 
 
 
398 aa  246  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.75 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  44.17 
 
 
411 aa  244  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  41.92 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  39.29 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  38.48 
 
 
383 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  38.04 
 
 
393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  37.84 
 
 
390 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  39.33 
 
 
387 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.59 
 
 
389 aa  242  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  38.04 
 
 
393 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  38.04 
 
 
393 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.56 
 
 
385 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.55 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  40.36 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  40.1 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  47.45 
 
 
385 aa  240  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  39.29 
 
 
393 aa  240  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  41.6 
 
 
372 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.8 
 
 
392 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  38.64 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.7 
 
 
397 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 
392 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  37.44 
 
 
379 aa  237  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 
386 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  45.02 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.4 
 
 
388 aa  236  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.82 
 
 
390 aa  236  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  38.4 
 
 
373 aa  235  9e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  38.68 
 
 
394 aa  235  9e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  45.24 
 
 
380 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  35.01 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  40.63 
 
 
423 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  41.4 
 
 
411 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  36.04 
 
 
380 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>