More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1002 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 380 aa  746    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  52.52 
 
 		 379 aa  315  6e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  51.07 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  50.41 
 
 		 405 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1446  Cystathionine gamma-lyase  52.63 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.819865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  46.63 
 
 		 376 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2858  cystathionine gamma-synthase  50.41 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2976  Cystathionine gamma-synthase  50.27 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1031  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  51.08 
 
 		 386 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5099  cystathionine gamma-synthase  51.88 
 
 		 400 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1549  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  47.57 
 
 		 377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0429741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  46.28 
 
 		 372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1414  cystathionine gamma-synthase  50.81 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  44.74 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  46.54 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  42.32 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  45.95 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  44.71 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  47.2 
 
 		 378 aa  270  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  45.24 
 
 		 379 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  46.03 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  45.62 
 
 		 383 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  44.95 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  47.06 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  44.66 
 
 		 387 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  41.05 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  44.85 
 
 		 387 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  41.01 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  41.25 
 
 		 388 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  40.63 
 
 		 378 aa  256  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.73 
 
 		 386 aa  255  9e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  45.09 
 
 		 381 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  37.47 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  45.62 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  44.13 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  45.26 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  42.11 
 
 		 378 aa  252  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  38.86 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  45.91 
 
 		 383 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  40.53 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  40.16 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  40.36 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  45.32 
 
 		 423 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  40.53 
 
 		 393 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  40.53 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  44.3 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  39.74 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 377 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  45.32 
 
 		 423 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  42.49 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.79 
 
 		 387 aa  249  7e-65  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  39.11 
 
 		 390 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.33 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  43.54 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  42.22 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  43.01 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  48.15 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  42.63 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  41.73 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.08 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  43.42 
 
 		 425 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  43.62 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  44.71 
 
 		 384 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  39.28 
 
 		 383 aa  245  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4640  Cystathionine gamma-lyase  43.36 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  42.06 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  40.32 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  39.47 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  40.36 
 
 		 394 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  40.94 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  41.42 
 
 		 390 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  44.59 
 
 		 380 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 		 393 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  40.94 
 
 		 390 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4095  cystathionine gamma-synthase  41.6 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  41.21 
 
 		 386 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.33 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  40.43 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  41.47 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  40.37 
 
 		 392 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 387 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.18 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0121  cystathionine gamma-synthase  41.95 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3807  cystathionine gamma-synthase  41.69 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  44.06 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.25 
 
 		 387 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.51 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  40.37 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  39.58 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  42.18 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.19 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.37 
 
 		 402 aa  238  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0120  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.45 
 
 		 386 aa  239  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1288  cystathionine gamma-lyase  36.46 
 
 		 379 aa  238  9e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.076956  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40.75 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>