More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1414 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1414  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 386 aa  763    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1031  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  91.45 
 
 		 386 aa  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  75.2 
 
 		 405 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5099  cystathionine gamma-synthase  77.98 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2858  cystathionine gamma-synthase  74.66 
 
 		 405 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2976  Cystathionine gamma-synthase  75.59 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  67.54 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  66.22 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1549  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  54.91 
 
 		 377 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0429741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1446  Cystathionine gamma-lyase  56.91 
 
 		 382 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.819865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  48.93 
 
 		 376 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  51.9 
 
 		 372 aa  323  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 371 aa  322  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  46.49 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  52.16 
 
 		 380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  51.35 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  45.28 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.81 
 
 		 379 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  45.9 
 
 		 392 aa  295  9e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  46.95 
 
 		 379 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  47.54 
 
 		 383 aa  292  7e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  45.83 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  50.81 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  45.36 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  46.45 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  46.45 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  46.45 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  46.79 
 
 		 393 aa  288  8e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  45.72 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  46.7 
 
 		 387 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  45.88 
 
 		 387 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  46.26 
 
 		 383 aa  285  9e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  44.74 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  47.33 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  45.72 
 
 		 388 aa  279  7e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  43.16 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  45.79 
 
 		 381 aa  272  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  46.61 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  43.92 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  43.86 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  47.62 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  48.83 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  47.17 
 
 		 372 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  46.48 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  42.01 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  45.89 
 
 		 380 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  41.11 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  43.65 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  46.03 
 
 		 380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  43.63 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  46.7 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  39.89 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  40.2 
 
 		 394 aa  256  3e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  41.85 
 
 		 378 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  43.28 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  48.15 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  42.74 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.74 
 
 		 397 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  41.34 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  41.16 
 
 		 398 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  42.67 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  42.4 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.58 
 
 		 386 aa  252  7e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  46.58 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.69 
 
 		 390 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  42.23 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  45.86 
 
 		 401 aa  249  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.53 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  38.9 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.12 
 
 		 387 aa  246  3e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  41.18 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1160  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  43.09 
 
 		 394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  40.41 
 
 		 380 aa  246  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  42.82 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 		 380 aa  245  8e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  42.89 
 
 		 390 aa  245  9e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  39.67 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  41.3 
 
 		 400 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  40.43 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.89 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.16 
 
 		 402 aa  243  6e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  37.03 
 
 		 392 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1055  Cystathionine gamma-synthase  44.7 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621556 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  40.31 
 
 		 419 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.84 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  41.46 
 
 		 392 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 387 aa  239  8e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0699  cystathionine beta-lyase  41.33 
 
 		 378 aa  239  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  40.76 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0343  methionine gamma-lyase  38.74 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0652905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  37.75 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>