More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2858 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2976  Cystathionine gamma-synthase  89.83 
 
 		 417 aa  680    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2858  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 405 aa  798    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  98.52 
 
 		 405 aa  790    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1031  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  75.85 
 
 		 386 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5099  cystathionine gamma-synthase  74.06 
 
 		 400 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1414  cystathionine gamma-synthase  74.54 
 
 		 386 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  66.67 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  62.73 
 
 		 379 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1549  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  54.72 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0429741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1446  Cystathionine gamma-lyase  54.45 
 
 		 382 aa  335  7.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.819865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  52.41 
 
 		 372 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 371 aa  332  6e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  47.87 
 
 		 376 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  51.35 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  46.63 
 
 		 373 aa  308  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  50.67 
 
 		 380 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.67 
 
 		 379 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  47.37 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  50.27 
 
 		 378 aa  295  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  47.11 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  46.45 
 
 		 383 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  47.8 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  47.41 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  47.41 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  47.41 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  47.35 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  47.61 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  46.99 
 
 		 387 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  43.94 
 
 		 390 aa  288  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 		 383 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  45.73 
 
 		 387 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  43.42 
 
 		 377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  46.72 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  47.45 
 
 		 372 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  44.27 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  42.66 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  44.97 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  43.5 
 
 		 389 aa  272  6e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  46.56 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  43.65 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.75 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  43.04 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  46.28 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  43.96 
 
 		 386 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  44.83 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  44.76 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 390 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  46.81 
 
 		 381 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.84 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.53 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 390 aa  262  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  45.22 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  43.63 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  44.17 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  40.94 
 
 		 388 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  45.21 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  46.7 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  41.21 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  42.62 
 
 		 381 aa  255  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  43.24 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  42.41 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  47.81 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  40.97 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  39.3 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.75 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0648  Cystathionine gamma-synthase  42.08 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  40.53 
 
 		 379 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.75 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.2 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  38.75 
 
 		 379 aa  249  8e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  39.74 
 
 		 381 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  41.37 
 
 		 386 aa  247  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0951  hypothetical protein  40.98 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  41.29 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  40.52 
 
 		 392 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  42.74 
 
 		 394 aa  246  6e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 379 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  45.91 
 
 		 401 aa  245  9e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  42.9 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  38.21 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  41.05 
 
 		 400 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  42.25 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  38.21 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.32 
 
 		 390 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  37.27 
 
 		 394 aa  242  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 380 aa  242  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1055  Cystathionine gamma-synthase  43.52 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.621556 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.09 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.01 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  38.13 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  38.48 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  40.27 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  42.82 
 
 		 378 aa  239  5.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 390 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  41.88 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.61 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>