More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1031 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1414  cystathionine gamma-synthase  91.45 
 
 		 386 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1031  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 386 aa  766    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537397  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3084  Cystathionine gamma-synthase  76.29 
 
 		 405 aa  557  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5099  cystathionine gamma-synthase  78.63 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.26401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2858  cystathionine gamma-synthase  75.75 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2976  Cystathionine gamma-synthase  76.9 
 
 		 417 aa  543  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0780  cystathionine gamma-synthase  68.11 
 
 		 379 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4330  hypothetical protein  65.68 
 
 		 379 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1549  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  55.44 
 
 		 377 aa  358  7e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0429741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1446  Cystathionine gamma-lyase  58.51 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.819865  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  48.13 
 
 		 376 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  52.91 
 
 		 372 aa  322  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  47.03 
 
 		 373 aa  317  3e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  52.43 
 
 		 380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  51.89 
 
 		 378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  51.08 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  48.81 
 
 		 379 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  44.74 
 
 		 390 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  46.09 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  47.55 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  47.55 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  47.55 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  48.1 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  46.95 
 
 		 379 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  47.83 
 
 		 393 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  46.98 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  46.99 
 
 		 387 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  49.05 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  46.47 
 
 		 390 aa  285  8e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  45.24 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  47.28 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  44.33 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  45.57 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  46.17 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  46.74 
 
 		 390 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  49.03 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  43.32 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  44.56 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  44.85 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  42.55 
 
 		 381 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  42.86 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  42.47 
 
 		 377 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  46.42 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  48.38 
 
 		 434 aa  266  5e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2638  Cystathionine gamma-synthase  46.39 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  48.14 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  41.46 
 
 		 381 aa  263  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  45.77 
 
 		 384 aa  262  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  47.11 
 
 		 380 aa  262  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4904  cystathionine gamma-lyase  43.36 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 379 aa  259  7e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  43.28 
 
 		 381 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  45.62 
 
 		 380 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  46.3 
 
 		 381 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  41.58 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  42.06 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  40.92 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  47.11 
 
 		 385 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  42.52 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  43.67 
 
 		 411 aa  255  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  43.13 
 
 		 401 aa  255  9e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.67 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 380 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  41.15 
 
 		 390 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  42.05 
 
 		 398 aa  252  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  42.31 
 
 		 397 aa  252  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  39.69 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  41.41 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.58 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  43.67 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.92 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  41.8 
 
 		 383 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  44.99 
 
 		 378 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  40.92 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.97 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  43.51 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3071  Cystathionine gamma-synthase  41.24 
 
 		 377 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  42.97 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  40.32 
 
 		 379 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  42.7 
 
 		 394 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  40.76 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  41.37 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  39.79 
 
 		 419 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  45 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.82 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  37.03 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  39.13 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  39.73 
 
 		 380 aa  243  6e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 		 426 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  41.56 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  39.89 
 
 		 380 aa  239  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  39.63 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  39.41 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  43.39 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  42.67 
 
 		 391 aa  238  9e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  40.7 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3252  Cystathionine gamma-synthase  42.59 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.326727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  40.65 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>