More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2807 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 
373 aa  748    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  76.73 
 
 
368 aa  569  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  72.97 
 
 
373 aa  553  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  55.31 
 
 
372 aa  351  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  46.49 
 
 
359 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  44.21 
 
 
398 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  43.57 
 
 
390 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.97 
 
 
400 aa  259  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.54 
 
 
406 aa  257  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.3 
 
 
391 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  41.28 
 
 
394 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.42 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.59 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  41.78 
 
 
393 aa  240  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  41.19 
 
 
381 aa  239  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  41.46 
 
 
390 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  41.64 
 
 
388 aa  238  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  38.24 
 
 
390 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  37.73 
 
 
388 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  37.98 
 
 
390 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  42.65 
 
 
383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  37.73 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  41.78 
 
 
392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  41.78 
 
 
392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  41.78 
 
 
392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  37.02 
 
 
383 aa  233  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  41.76 
 
 
397 aa  232  9e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  40.24 
 
 
377 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  39.68 
 
 
377 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  37.53 
 
 
386 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.65 
 
 
378 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  38.81 
 
 
387 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  37.17 
 
 
378 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  37 
 
 
377 aa  227  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.14 
 
 
389 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  41.81 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  41.54 
 
 
379 aa  226  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.94 
 
 
392 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.71 
 
 
387 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  41.25 
 
 
387 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  39.06 
 
 
392 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  39.35 
 
 
390 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  40.31 
 
 
387 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  39.94 
 
 
390 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.73 
 
 
377 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.53 
 
 
377 aa  222  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.53 
 
 
377 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  37.46 
 
 
380 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.65 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  36.53 
 
 
377 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.53 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  36.53 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  36.53 
 
 
377 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  36.68 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.53 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  38.36 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.12 
 
 
385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.27 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  42.36 
 
 
372 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3986  Cystathionine gamma-lyase  37.9 
 
 
390 aa  220  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.891529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  40.52 
 
 
378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  40 
 
 
401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  41 
 
 
381 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.24 
 
 
387 aa  219  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  37.74 
 
 
390 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39 
 
 
398 aa  219  7e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  42.36 
 
 
423 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 
383 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  38.23 
 
 
394 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 
376 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  42.36 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.44 
 
 
387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.16 
 
 
387 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.38 
 
 
387 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 
386 aa  216  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  38.89 
 
 
394 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  38.61 
 
 
394 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  41.44 
 
 
380 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  35.51 
 
 
371 aa  215  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  40.47 
 
 
381 aa  215  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.38 
 
 
387 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  38.38 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.63 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  36.04 
 
 
392 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.82 
 
 
388 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.06 
 
 
390 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  35.09 
 
 
380 aa  215  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  38.38 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  36.24 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  37.83 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.74 
 
 
386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  40.94 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  38.48 
 
 
389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  39.35 
 
 
386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  41.72 
 
 
387 aa  212  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.35 
 
 
422 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  39.18 
 
 
383 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  37.54 
 
 
393 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.46 
 
 
389 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>