More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 398 aa  777    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  73.21 
 
 		 378 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  62.76 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  66.07 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  62.47 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  55.7 
 
 		 396 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  55.32 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  56.14 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  54.96 
 
 		 359 aa  362  6e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.98 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.8 
 
 		 372 aa  292  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.9 
 
 		 373 aa  291  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.21 
 
 		 373 aa  279  6e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  42.46 
 
 		 392 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  43.12 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  43.04 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  43.16 
 
 		 379 aa  264  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  44.65 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  43.13 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  42.4 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  42.18 
 
 		 383 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  43.85 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  42.78 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.82 
 
 		 389 aa  256  7e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  39.04 
 
 		 378 aa  255  7e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  38.28 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 		 377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  38.36 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  38.02 
 
 		 378 aa  253  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  40.11 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  41.18 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  41.24 
 
 		 411 aa  250  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  42.09 
 
 		 381 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.37 
 
 		 387 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.11 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  38.85 
 
 		 393 aa  249  9e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.11 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  43.05 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.85 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  42.19 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.85 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 393 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  40.63 
 
 		 386 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  40.28 
 
 		 378 aa  246  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  42.09 
 
 		 410 aa  246  6e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  38.93 
 
 		 386 aa  245  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  38.3 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.62 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  38.99 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  38.89 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  43.7 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  38.1 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  37.17 
 
 		 381 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0177  cystathionine gamma-synthase  40.85 
 
 		 386 aa  242  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20810  cystathionine gamma-lyase  43.22 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  37.93 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  41.62 
 
 		 392 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  40 
 
 		 388 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  39.69 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01681  cystathionine gamma-synthase  39.12 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  41.13 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  39.84 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.17 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  41.78 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.11 
 
 		 394 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 380 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.35 
 
 		 388 aa  239  9e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  45.72 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  41.56 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  38.32 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  35.97 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  37.33 
 
 		 380 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  41.18 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.79 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  39.2 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  40.05 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  43.44 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  38.93 
 
 		 390 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.32 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3143  cystathionine gamma-synthase  39.1 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  39.9 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  39.58 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3333  Cystathionine gamma-synthase  39.1 
 
 		 426 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  39.79 
 
 		 389 aa  236  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 		 386 aa  235  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3154  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  40.58 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>