More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3959 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 372 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  57.18 
 
 		 368 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  55.31 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  56.32 
 
 		 373 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  54.47 
 
 		 406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.74 
 
 		 391 aa  322  9.000000000000001e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.01 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  49.59 
 
 		 359 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  48.8 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  46.21 
 
 		 394 aa  300  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.24 
 
 		 400 aa  299  7e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  48.42 
 
 		 390 aa  295  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.36 
 
 		 396 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  44.41 
 
 		 388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  42.37 
 
 		 376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  42.78 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  41.34 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  39.16 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.47 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 		 392 aa  249  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  40.36 
 
 		 401 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  43.01 
 
 		 383 aa  249  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0328  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.57 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0116311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.02 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  43.78 
 
 		 372 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 390 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  42.02 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  39.73 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  42.02 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  42.02 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  40.26 
 
 		 379 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  42.29 
 
 		 393 aa  245  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  40.94 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  42.71 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  41.3 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0622  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.05 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.36 
 
 		 394 aa  242  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  40.86 
 
 		 390 aa  242  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  42.25 
 
 		 389 aa  242  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.57 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.47 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1055  cystathionine gamma-synthase  44.35 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.11 
 
 		 378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  40.48 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.62 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  38.16 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  39.69 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  39.69 
 
 		 393 aa  235  8e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4408  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  45.43 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.206162 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  40.21 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  39.16 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  37.63 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  44.7 
 
 		 385 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  38.36 
 
 		 381 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  37.63 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.95 
 
 		 387 aa  232  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  39.63 
 
 		 390 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.79 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.43 
 
 		 387 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  41.09 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.26 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  41.09 
 
 		 423 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  40.53 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  40.53 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.8 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.38 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1876  Cystathionine gamma-lyase  36.73 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.43 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  38.52 
 
 		 380 aa  229  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  38.6 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.34 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.16 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  39.26 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  40.42 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.16 
 
 		 387 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  39.01 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  39.17 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  38.79 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  38.82 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  37.8 
 
 		 386 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  39.16 
 
 		 393 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3453  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  45 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.929327  hitchhiker  0.000612304 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  38.64 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  36.91 
 
 		 383 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  38.72 
 
 		 392 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  39.79 
 
 		 381 aa  225  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  39.58 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  38.08 
 
 		 392 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  42.42 
 
 		 411 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4479  cystathionine gamma-synthase  38.22 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.146972  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  39.85 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3050  cystathionine gamma-synthase  41.82 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  38.4 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  38.46 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  36.81 
 
 		 378 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  36.56 
 
 		 377 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4046  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.22 
 
 		 386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>