More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2290 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 
378 aa  737    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  73.21 
 
 
398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  67.62 
 
 
391 aa  458  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  64.96 
 
 
400 aa  458  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  63.66 
 
 
390 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.33 
 
 
396 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  58.49 
 
 
394 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  57.22 
 
 
406 aa  360  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  53.91 
 
 
359 aa  352  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  52.01 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.67 
 
 
368 aa  293  5e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.75 
 
 
373 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  44.53 
 
 
390 aa  275  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  43.42 
 
 
393 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 
392 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 
392 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  43.85 
 
 
392 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 
388 aa  270  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.59 
 
 
373 aa  268  8.999999999999999e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  43.58 
 
 
383 aa  266  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 
377 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  43.7 
 
 
379 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  43.05 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  41.98 
 
 
379 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  42.2 
 
 
390 aa  249  4e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  41.87 
 
 
388 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  37.6 
 
 
400 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  41.21 
 
 
378 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  41.67 
 
 
389 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  41.33 
 
 
390 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  41.07 
 
 
390 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  43.32 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  40.8 
 
 
390 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  41.51 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  41.33 
 
 
387 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  39.39 
 
 
378 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  44.81 
 
 
400 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  43.28 
 
 
383 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  38.24 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  42.78 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  39.79 
 
 
377 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  40.36 
 
 
390 aa  239  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  37.8 
 
 
379 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.71 
 
 
392 aa  239  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 
380 aa  239  8e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  40.22 
 
 
380 aa  239  8e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  37.83 
 
 
390 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4786  cystathionine gamma-synthase  40.74 
 
 
386 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330787 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  38.63 
 
 
377 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  40.64 
 
 
381 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  42.78 
 
 
383 aa  236  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  38.9 
 
 
377 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  45.63 
 
 
367 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  45.63 
 
 
367 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.2 
 
 
392 aa  236  6e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  38.9 
 
 
377 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  38.9 
 
 
377 aa  236  6e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  37.37 
 
 
393 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 
380 aa  235  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  38.63 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.17 
 
 
378 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  37.37 
 
 
393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  39.01 
 
 
381 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  38.63 
 
 
377 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  45.35 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  37.37 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  39.42 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  38.4 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  40.32 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  38.63 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  38.63 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  38.63 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  38.63 
 
 
377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 
386 aa  233  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  38.63 
 
 
377 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  37.1 
 
 
378 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3791  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  39.95 
 
 
386 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4347  cystathionine gamma-synthase  40.11 
 
 
386 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4317  cystathionine gamma-synthase  40.11 
 
 
386 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  40.59 
 
 
387 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  40.86 
 
 
410 aa  231  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4434  cystathionine gamma-synthase  40.11 
 
 
386 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188504  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4501  cystathionine gamma-synthase  40.11 
 
 
386 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0840458  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4431  cystathionine gamma-synthase  40.63 
 
 
386 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  41.24 
 
 
384 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  37.81 
 
 
380 aa  230  3e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  37.76 
 
 
398 aa  230  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2142  cystathionine gamma-lyase  42.82 
 
 
369 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  40.48 
 
 
372 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1264  trans-sulfuration enzyme family protein  38.06 
 
 
383 aa  229  5e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0391596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4035  cystathionine gamma-synthase  39.58 
 
 
386 aa  229  6e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  45.74 
 
 
385 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  40.95 
 
 
383 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.85 
 
 
394 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0189  cystathionine gamma-synthase  39.95 
 
 
425 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0615  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.46 
 
 
390 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  39.44 
 
 
397 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  35.48 
 
 
383 aa  226  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  38.29 
 
 
405 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  39.37 
 
 
394 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>