More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1928 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 367 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 367 aa  726    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  99.73 
 
 		 367 aa  725    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2142  cystathionine gamma-lyase  75.75 
 
 		 369 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  74.66 
 
 		 369 aa  553  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5997  cystathionine gamma-lyase  52.89 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.847567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1158  cystathionine gamma-lyase  52.39 
 
 		 373 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0760832  unclonable  0.0000000519282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  50.41 
 
 		 400 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1267  cystathionine gamma-lyase  53.99 
 
 		 371 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.929061 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22690  cystathionine gamma-lyase  50.28 
 
 		 392 aa  289  7e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.73 
 
 		 379 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1684  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.38 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  43.49 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  42.51 
 
 		 379 aa  239  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  39.43 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  43.41 
 
 		 379 aa  236  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.02 
 
 		 400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  39.34 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  42.99 
 
 		 383 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.63 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  43.07 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  38.94 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  38.5 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0293  cystathionine gamma-lyase  38.94 
 
 		 380 aa  228  9e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000375953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  39.02 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  42.28 
 
 		 387 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  42.94 
 
 		 392 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  40.96 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  41.87 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  38.5 
 
 		 387 aa  225  8e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  39.21 
 
 		 390 aa  225  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  36.31 
 
 		 392 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  42.69 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  40.85 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  41.87 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  37.43 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  38.03 
 
 		 374 aa  223  3e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  43.33 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  39.18 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  41.49 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  39.18 
 
 		 423 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  42.64 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  41.62 
 
 		 387 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  37.11 
 
 		 376 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  40.24 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  40.06 
 
 		 392 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  40.06 
 
 		 392 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  40.06 
 
 		 392 aa  219  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  38.23 
 
 		 392 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  38.74 
 
 		 389 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  40 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  44.44 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  41.34 
 
 		 391 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.95 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.93 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  39.88 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  39.18 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  38.9 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  36.29 
 
 		 380 aa  216  4e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  34.43 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  40.23 
 
 		 381 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  36.9 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  36.9 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  36.9 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  38.57 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  38.87 
 
 		 383 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  39.57 
 
 		 398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  36.61 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  36.31 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  36.31 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  39.22 
 
 		 378 aa  213  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  36.98 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  35.03 
 
 		 386 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  36.31 
 
 		 377 aa  212  7e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  40.18 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  36.11 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  37.4 
 
 		 384 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  40.44 
 
 		 383 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  39.76 
 
 		 378 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  37.22 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1212  Cystathionine gamma-synthase  34.85 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  38.19 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  36.83 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  36.44 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  39.34 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  36.61 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1002  cystathionine gamma-synthase  41.1 
 
 		 380 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.282696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  42.01 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  33.93 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.33 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  37.31 
 
 		 378 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  39.47 
 
 		 377 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  37.85 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88245  cystathione beta lyase  36.69 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0106634  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.28 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  37.95 
 
 		 397 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>