More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2142 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2142  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 
369 aa  737    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  81.47 
 
 
369 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  75.75 
 
 
367 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  75.48 
 
 
367 aa  549  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  75.75 
 
 
367 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1158  cystathionine gamma-lyase  52.11 
 
 
373 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0760832  unclonable  0.0000000519282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5997  cystathionine gamma-lyase  51.64 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.847567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1267  cystathionine gamma-lyase  52.76 
 
 
371 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.929061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  48.48 
 
 
400 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22690  cystathionine gamma-lyase  45.6 
 
 
392 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.81 
 
 
379 aa  262  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1684  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.32 
 
 
410 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  42.9 
 
 
390 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  39.27 
 
 
387 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  39.27 
 
 
379 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.82 
 
 
378 aa  223  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  39.03 
 
 
393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  38.87 
 
 
379 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  38.58 
 
 
393 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  37.96 
 
 
383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  38.16 
 
 
390 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  38.96 
 
 
394 aa  215  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  38.34 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  40 
 
 
383 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1212  Cystathionine gamma-synthase  37.24 
 
 
403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2245  methionine gamma-lyase  34.08 
 
 
390 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  39.33 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  35.68 
 
 
377 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  37.46 
 
 
376 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  40.5 
 
 
387 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  39.38 
 
 
401 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0863  cystathionine gamma-synthase  40.12 
 
 
380 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  33.61 
 
 
386 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  36.5 
 
 
381 aa  210  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  34.81 
 
 
392 aa  209  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  39.53 
 
 
380 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  37.84 
 
 
389 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  41.23 
 
 
359 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  36.87 
 
 
387 aa  206  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41.18 
 
 
398 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.94 
 
 
400 aa  206  7e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  34.93 
 
 
374 aa  205  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  39.5 
 
 
378 aa  205  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  39.37 
 
 
392 aa  205  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.03 
 
 
396 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  38.52 
 
 
391 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  39.52 
 
 
383 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  39.29 
 
 
387 aa  205  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  37.21 
 
 
381 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  39.18 
 
 
423 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  39.16 
 
 
381 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  35.49 
 
 
392 aa  203  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  36.87 
 
 
387 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  33.33 
 
 
392 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  35.5 
 
 
378 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  34.03 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  38.89 
 
 
423 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  33.73 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  34.03 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  35.78 
 
 
392 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  33.73 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  34.03 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  34.03 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  34.03 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.57 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  34.03 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  35.93 
 
 
380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  33.73 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  39.29 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  34.48 
 
 
384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  38.71 
 
 
398 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  34.54 
 
 
383 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  37.17 
 
 
378 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  34.03 
 
 
377 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0900  Cystathionine gamma-synthase  35.77 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  37.54 
 
 
392 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  37.54 
 
 
392 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  37.54 
 
 
392 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0440  cystathionine gamma-synthase  38.86 
 
 
381 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2737  methionine gamma-lyase  37.83 
 
 
400 aa  199  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428956  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  33.73 
 
 
377 aa  199  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  35.2 
 
 
392 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  34.64 
 
 
394 aa  199  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  36.98 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  34.22 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1830  cystathionine gamma-synthase  36.39 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.956648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  36.2 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  34.93 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  35.6 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  32.94 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  39.41 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  35.09 
 
 
390 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  32.93 
 
 
378 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  35.47 
 
 
378 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3649  methionine gamma-lyase  37.2 
 
 
418 aa  196  6e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  37.69 
 
 
378 aa  196  7e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  37.05 
 
 
394 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  37.69 
 
 
396 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3858  cystathionine gamma-synthase  34.52 
 
 
381 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000091945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  36.74 
 
 
368 aa  195  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>