More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4046 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 379 aa  738    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1158  cystathionine gamma-lyase  56.67 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0760832  unclonable  0.0000000519282 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  55.56 
 
 		 400 aa  364  1e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1267  cystathionine gamma-lyase  58.31 
 
 		 371 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.929061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5997  cystathionine gamma-lyase  56.37 
 
 		 375 aa  347  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.847567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  50 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  50.4 
 
 		 367 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  50.4 
 
 		 367 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  50.13 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2142  cystathionine gamma-lyase  47.73 
 
 		 369 aa  296  4e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1684  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.33 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22690  cystathionine gamma-lyase  46.63 
 
 		 392 aa  260  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.99 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.43 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  38.48 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  38.6 
 
 		 383 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  43.15 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  41.1 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6707  Cystathionine gamma-lyase  38.34 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0718  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.6 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.77 
 
 		 368 aa  216  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.36 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  37.83 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  37.89 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  38.68 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  37.93 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  37.93 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3292  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.85 
 
 		 359 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.813307  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  37.93 
 
 		 392 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  35.19 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  37.92 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2311  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  42.39 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.110307  hitchhiker  0.00307802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  37.93 
 
 		 379 aa  209  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  36.89 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  37.93 
 
 		 379 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  33.7 
 
 		 392 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  37.8 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  32.98 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  35.08 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  36.81 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.67 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  36.55 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  36.15 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  36.55 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  37.56 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0909  Cystathionine gamma-lyase  41.74 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.999946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  34.7 
 
 		 386 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  34.66 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.28 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4420  Cystathionine gamma-synthase  38.48 
 
 		 389 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1099  Cystathionine gamma-lyase  35.86 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.352445  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  38.74 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  36.36 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  37.01 
 
 		 383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0913  cystathionine gamma-synthase  35.88 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.646097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  35.68 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0732  cystathionine gamma-synthase  37.83 
 
 		 400 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  35.57 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2386  Cystathionine gamma-lyase  36.46 
 
 		 401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  35.2 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3903  cystathionine gamma-lyase  35.04 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  36.16 
 
 		 376 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2001  Cystathionine gamma-synthase  37.36 
 
 		 378 aa  197  3e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  36.12 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  36.81 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  38.36 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  34.97 
 
 		 386 aa  197  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5637  Cystathionine gamma-lyase  32.03 
 
 		 379 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  38.97 
 
 		 392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2896  Cystathionine gamma-synthase  38.86 
 
 		 402 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.063757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  34.95 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  38.95 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  36.39 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  33.96 
 
 		 377 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4016  cystathionine gamma-synthase  41.43 
 
 		 372 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.683871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  34.62 
 
 		 405 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  35.42 
 
 		 380 aa  196  8.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1546  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  36.88 
 
 		 402 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  39.17 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.25 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  34.02 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  37.4 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  36.88 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  31.13 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  37.64 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0095  trans-sulfuration enzyme family protein  34.07 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0886  cystathionine beta-lyase  33.52 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0482  cystathionine gamma-synthase  33.52 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0495  cystathionine gamma-synthase  33.52 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  32.74 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  37.94 
 
 		 378 aa  192  7e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  37.37 
 
 		 423 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2200  methionine gamma-lyase  32.99 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0407329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4124  cystathionine gamma-lyase  34.44 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  36.51 
 
 		 384 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  32.17 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.312528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  37.01 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  33.07 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  35.7 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  37.37 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>