More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1267 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1267  cystathionine gamma-lyase  100 
 
 		 371 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.929061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1158  cystathionine gamma-lyase  88.86 
 
 		 373 aa  604  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0760832  unclonable  0.0000000519282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5997  cystathionine gamma-lyase  59.56 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.847567  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1425  cystathionine gamma-lyase  56.32 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.144406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4046  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.06 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4220  cystathionine gamma-lyase  51.93 
 
 		 369 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2142  cystathionine gamma-lyase  52.76 
 
 		 369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1928  cystathionine gamma-lyase  53.99 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1974  cystathionine gamma-lyase  53.99 
 
 		 367 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.798909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1908  cystathionine gamma-lyase  53.72 
 
 		 367 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.971857  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1684  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  54.69 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22690  cystathionine gamma-lyase  50 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0702  Cystathionine gamma-synthase  38.46 
 
 		 383 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.558614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  37.11 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  38.73 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1092  Cystathionine gamma-synthase  37.44 
 
 		 393 aa  203  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.38865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31860  cystathionine gamma-lyase  39.27 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  33.59 
 
 		 378 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1581  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.84 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.316874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3023  cystathionine gamma-synthase  35.13 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.033254  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0844  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  36.67 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0937  Cystathionine gamma-synthase  38.04 
 
 		 411 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3151  Cystathionine gamma-synthase  36.6 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  37.7 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3061  cystathionine gamma-synthase  35.71 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  37.83 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0494  Cystathionine gamma-lyase  32.89 
 
 		 379 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1615  cystathionine gamma-synthase  37.66 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11150  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  40.05 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0840629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1559  cystathionine gamma-lyase  36.87 
 
 		 387 aa  192  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1506  Cystathionine gamma-synthase  39.7 
 
 		 373 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4146  cystathionine gamma-synthase  36.77 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00234091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  39.13 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4377  cystathionine gamma-synthase  36.77 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0167479  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4541  methionine gamma-lyase  37.31 
 
 		 398 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4221  cystathionine gamma-synthase  36.77 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.168844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3959  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  41.91 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.100103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11097  cystathionine gamma-synthase  36.7 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00214161  normal  0.379656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1913  cystathionine gamma-synthase  40.24 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.415467  normal  0.644507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0072  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.05 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.152477  normal  0.89732 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1681  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  36.8 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.869508  hitchhiker  0.00595752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  38.42 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2046  cystathionine gamma-synthase  37.04 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00917338  normal  0.373724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0909  Cystathionine gamma-lyase  40.85 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.999946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  33.73 
 
 		 392 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1982  cystathionine beta-lyase  35.73 
 
 		 389 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1362  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  43.71 
 
 		 406 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2908  Cystathionine gamma-lyase  32.89 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.511064  hitchhiker  0.00000019039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3411  Cystathionine gamma-synthase  37.53 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.0474144 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  36.31 
 
 		 380 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  35.16 
 
 		 387 aa  189  5.999999999999999e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0771  methionine gamma-lyase  36.69 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153007  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  37.69 
 
 		 392 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2761  cystathionine gamma-synthase  37.3 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000790789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3697  cystathionine gamma-synthase  35.99 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  36.98 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1594  Cystathionine gamma-lyase  38.86 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.320611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1618  Cystathionine gamma-synthase  36.39 
 
 		 383 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0184  Cystathionine gamma-synthase  41.07 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1266  Cystathionine gamma-synthase  37.69 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.547301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0506  cystathionine gamma-synthase  34.49 
 
 		 377 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4416  methionine gamma-lyase  37.19 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.510937 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01446  Cystathionine gamma-lyase (EC 4.4.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:B2LXT6]  35.6 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.332216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0658  cystathionine gamma-synthase  37.85 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  33.77 
 
 		 378 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0659  cystathionine gamma-synthase  37.76 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  35 
 
 		 378 aa  187  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3473  cystathionine gamma-synthase  40.12 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  0.010715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0798  methionine gamma-lyase  38.44 
 
 		 396 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1308  methionine gamma-lyase  37.25 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1050  Cystathionine gamma-synthase  37.89 
 
 		 383 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  36.03 
 
 		 378 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0915  methionine gamma-lyase  36.41 
 
 		 397 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.13 
 
 		 422 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0693  cystathionine gamma-synthase  37.76 
 
 		 423 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0520598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2219  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  35.79 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1948  Cystathionine gamma-synthase  35.4 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2008  Cystathionine gamma-lyase  35.79 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.31334e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0169  cystathionine beta-lyase  33.92 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0944  cystathionine beta-lyase  36.06 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  34.54 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08000  Cystathionine gamma-synthase  31.79 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.272555  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3983  Cystathionine gamma-synthase  33.6 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000782604  normal  0.941842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0921  hypothetical protein  35.06 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4210  Cystathionine gamma-synthase  37.77 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  36.84 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  33.16 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  38.62 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  32.2 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1563  cystathionine gamma-synthase  36.01 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0740751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2807  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.7 
 
 		 373 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6425  cystathionine gamma-synthase  41.39 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.224608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2499  cystathionine gamma-lyase  29.89 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.722744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  36.18 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0374  cystathionine gamma-lyase  38.06 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2290  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.2 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.340789  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1831  cystathionine gamma-synthase  34.2 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0011  methionine gamma-lyase  40.77 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0933  Cystathionine gamma-synthase  36.71 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  37.21 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>